Protein–RNA interactions for Protein: O75955

FLOT1, Flotillin-1, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLOT1O75955 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
FLOT1O75955 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
FLOT1O75955 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
FLOT1O75955 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
FLOT1O75955 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
FLOT1O75955 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
FLOT1O75955 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
FLOT1O75955 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
FLOT1O75955 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
FLOT1O75955 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
FLOT1O75955 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
FLOT1O75955 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
FLOT1O75955 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
FLOT1O75955 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
FLOT1O75955 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
FLOT1O75955 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
FLOT1O75955 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
FLOT1O75955 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
FLOT1O75955 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
FLOT1O75955 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
FLOT1O75955 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
FLOT1O75955 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
FLOT1O75955 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
FLOT1O75955 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
FLOT1O75955 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
FLOT1O75955 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
FLOT1O75955 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
FLOT1O75955 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
FLOT1O75955 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
FLOT1O75955 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
FLOT1O75955 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
FLOT1O75955 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
FLOT1O75955 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
FLOT1O75955 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
FLOT1O75955 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
FLOT1O75955 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
FLOT1O75955 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
FLOT1O75955 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
FLOT1O75955 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
FLOT1O75955 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
FLOT1O75955 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
FLOT1O75955 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
FLOT1O75955 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
FLOT1O75955 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
FLOT1O75955 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
FLOT1O75955 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
FLOT1O75955 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
FLOT1O75955 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
FLOT1O75955 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
FLOT1O75955 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
FLOT1O75955 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
FLOT1O75955 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
FLOT1O75955 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
FLOT1O75955 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
FLOT1O75955 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
FLOT1O75955 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
FLOT1O75955 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
FLOT1O75955 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
FLOT1O75955 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
FLOT1O75955 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
FLOT1O75955 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
FLOT1O75955 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
FLOT1O75955 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
FLOT1O75955 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
FLOT1O75955 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
FLOT1O75955 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
FLOT1O75955 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
FLOT1O75955 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
FLOT1O75955 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
FLOT1O75955 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
FLOT1O75955 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
FLOT1O75955 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
FLOT1O75955 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
FLOT1O75955 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
FLOT1O75955 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
FLOT1O75955 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
FLOT1O75955 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
FLOT1O75955 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
FLOT1O75955 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
FLOT1O75955 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
FLOT1O75955 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
FLOT1O75955 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
FLOT1O75955 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
FLOT1O75955 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
FLOT1O75955 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
FLOT1O75955 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
FLOT1O75955 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
FLOT1O75955 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
FLOT1O75955 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
FLOT1O75955 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
FLOT1O75955 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
FLOT1O75955 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
FLOT1O75955 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
FLOT1O75955 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
FLOT1O75955 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
FLOT1O75955 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
FLOT1O75955 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
FLOT1O75955 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
FLOT1O75955 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
FLOT1O75955 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms