Protein–RNA interactions for Protein: O75935

DCTN3, Dynactin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN3O75935 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DCTN3O75935 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
DCTN3O75935 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DCTN3O75935 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
DCTN3O75935 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DCTN3O75935 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DCTN3O75935 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DCTN3O75935 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DCTN3O75935 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DCTN3O75935 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DCTN3O75935 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DCTN3O75935 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DCTN3O75935 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DCTN3O75935 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DCTN3O75935 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DCTN3O75935 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DCTN3O75935 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
DCTN3O75935 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DCTN3O75935 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DCTN3O75935 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DCTN3O75935 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DCTN3O75935 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DCTN3O75935 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DCTN3O75935 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
DCTN3O75935 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
DCTN3O75935 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DCTN3O75935 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DCTN3O75935 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DCTN3O75935 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DCTN3O75935 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DCTN3O75935 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DCTN3O75935 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
DCTN3O75935 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DCTN3O75935 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DCTN3O75935 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DCTN3O75935 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
DCTN3O75935 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DCTN3O75935 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DCTN3O75935 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DCTN3O75935 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DCTN3O75935 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DCTN3O75935 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DCTN3O75935 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DCTN3O75935 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DCTN3O75935 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DCTN3O75935 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DCTN3O75935 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DCTN3O75935 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DCTN3O75935 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DCTN3O75935 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DCTN3O75935 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DCTN3O75935 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DCTN3O75935 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DCTN3O75935 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
DCTN3O75935 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DCTN3O75935 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DCTN3O75935 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DCTN3O75935 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DCTN3O75935 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DCTN3O75935 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DCTN3O75935 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DCTN3O75935 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DCTN3O75935 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DCTN3O75935 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DCTN3O75935 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
DCTN3O75935 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
DCTN3O75935 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DCTN3O75935 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25■■□□□ 1.59
DCTN3O75935 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
DCTN3O75935 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DCTN3O75935 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DCTN3O75935 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DCTN3O75935 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DCTN3O75935 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DCTN3O75935 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DCTN3O75935 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DCTN3O75935 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DCTN3O75935 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
DCTN3O75935 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DCTN3O75935 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DCTN3O75935 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DCTN3O75935 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DCTN3O75935 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DCTN3O75935 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DCTN3O75935 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
DCTN3O75935 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DCTN3O75935 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
DCTN3O75935 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DCTN3O75935 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DCTN3O75935 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DCTN3O75935 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DCTN3O75935 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DCTN3O75935 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DCTN3O75935 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DCTN3O75935 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DCTN3O75935 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DCTN3O75935 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DCTN3O75935 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DCTN3O75935 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DCTN3O75935 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms