Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SIN3BO75182 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SIN3BO75182 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SIN3BO75182 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SIN3BO75182 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SIN3BO75182 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SIN3BO75182 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SIN3BO75182 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SIN3BO75182 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SIN3BO75182 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SIN3BO75182 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SIN3BO75182 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SIN3BO75182 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SIN3BO75182 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SIN3BO75182 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SIN3BO75182 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SIN3BO75182 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SIN3BO75182 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SIN3BO75182 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SIN3BO75182 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SIN3BO75182 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SIN3BO75182 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SIN3BO75182 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SIN3BO75182 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SIN3BO75182 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SIN3BO75182 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SIN3BO75182 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SIN3BO75182 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SIN3BO75182 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SIN3BO75182 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SIN3BO75182 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SIN3BO75182 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SIN3BO75182 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SIN3BO75182 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SIN3BO75182 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SIN3BO75182 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SIN3BO75182 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SIN3BO75182 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SIN3BO75182 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SIN3BO75182 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SIN3BO75182 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SIN3BO75182 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SIN3BO75182 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
SIN3BO75182 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SIN3BO75182 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SIN3BO75182 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SIN3BO75182 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SIN3BO75182 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SIN3BO75182 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SIN3BO75182 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SIN3BO75182 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SIN3BO75182 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SIN3BO75182 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SIN3BO75182 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SIN3BO75182 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SIN3BO75182 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SIN3BO75182 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SIN3BO75182 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SIN3BO75182 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SIN3BO75182 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SIN3BO75182 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SIN3BO75182 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SIN3BO75182 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SIN3BO75182 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SIN3BO75182 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SIN3BO75182 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SIN3BO75182 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SIN3BO75182 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SIN3BO75182 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SIN3BO75182 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SIN3BO75182 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SIN3BO75182 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SIN3BO75182 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SIN3BO75182 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SIN3BO75182 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SIN3BO75182 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SIN3BO75182 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SIN3BO75182 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SIN3BO75182 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SIN3BO75182 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SIN3BO75182 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SIN3BO75182 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SIN3BO75182 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SIN3BO75182 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SIN3BO75182 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SIN3BO75182 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SIN3BO75182 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SIN3BO75182 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SIN3BO75182 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SIN3BO75182 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SIN3BO75182 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SIN3BO75182 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SIN3BO75182 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SIN3BO75182 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SIN3BO75182 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SIN3BO75182 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SIN3BO75182 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SIN3BO75182 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SIN3BO75182 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SIN3BO75182 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms