Protein–RNA interactions for Protein: O15335

CHAD, Chondroadherin, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHADO15335 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHADO15335 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHADO15335 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHADO15335 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHADO15335 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHADO15335 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHADO15335 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHADO15335 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHADO15335 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHADO15335 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CHADO15335 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHADO15335 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHADO15335 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHADO15335 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHADO15335 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHADO15335 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHADO15335 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHADO15335 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHADO15335 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHADO15335 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHADO15335 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHADO15335 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHADO15335 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHADO15335 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHADO15335 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHADO15335 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHADO15335 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHADO15335 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHADO15335 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHADO15335 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHADO15335 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHADO15335 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHADO15335 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHADO15335 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHADO15335 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHADO15335 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHADO15335 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHADO15335 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHADO15335 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHADO15335 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHADO15335 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHADO15335 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHADO15335 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHADO15335 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHADO15335 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHADO15335 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHADO15335 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHADO15335 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHADO15335 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CHADO15335 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
CHADO15335 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CHADO15335 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CHADO15335 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHADO15335 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHADO15335 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHADO15335 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHADO15335 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHADO15335 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHADO15335 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHADO15335 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHADO15335 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHADO15335 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHADO15335 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHADO15335 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHADO15335 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHADO15335 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHADO15335 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHADO15335 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHADO15335 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHADO15335 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHADO15335 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHADO15335 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHADO15335 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHADO15335 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHADO15335 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHADO15335 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHADO15335 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CHADO15335 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHADO15335 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHADO15335 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHADO15335 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHADO15335 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHADO15335 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHADO15335 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHADO15335 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHADO15335 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHADO15335 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHADO15335 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHADO15335 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHADO15335 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHADO15335 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CHADO15335 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHADO15335 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHADO15335 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHADO15335 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHADO15335 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHADO15335 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHADO15335 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHADO15335 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHADO15335 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.9 ms