Protein–RNA interactions for Protein: O15020

SPTBN2, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 2, humanhuman

Predictions only

Length 2,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN2O15020 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPTBN2O15020 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPTBN2O15020 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPTBN2O15020 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPTBN2O15020 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPTBN2O15020 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SPTBN2O15020 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SPTBN2O15020 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPTBN2O15020 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPTBN2O15020 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPTBN2O15020 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPTBN2O15020 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPTBN2O15020 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPTBN2O15020 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPTBN2O15020 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPTBN2O15020 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPTBN2O15020 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPTBN2O15020 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SPTBN2O15020 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SPTBN2O15020 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPTBN2O15020 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPTBN2O15020 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPTBN2O15020 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPTBN2O15020 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPTBN2O15020 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPTBN2O15020 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPTBN2O15020 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPTBN2O15020 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPTBN2O15020 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPTBN2O15020 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPTBN2O15020 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPTBN2O15020 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPTBN2O15020 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPTBN2O15020 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SPTBN2O15020 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPTBN2O15020 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SPTBN2O15020 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPTBN2O15020 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPTBN2O15020 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPTBN2O15020 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPTBN2O15020 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPTBN2O15020 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SPTBN2O15020 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPTBN2O15020 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPTBN2O15020 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPTBN2O15020 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPTBN2O15020 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
SPTBN2O15020 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SPTBN2O15020 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SPTBN2O15020 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SPTBN2O15020 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPTBN2O15020 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPTBN2O15020 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPTBN2O15020 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPTBN2O15020 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPTBN2O15020 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPTBN2O15020 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPTBN2O15020 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPTBN2O15020 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPTBN2O15020 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPTBN2O15020 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPTBN2O15020 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPTBN2O15020 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPTBN2O15020 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SPTBN2O15020 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPTBN2O15020 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPTBN2O15020 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPTBN2O15020 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SPTBN2O15020 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPTBN2O15020 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SPTBN2O15020 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPTBN2O15020 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPTBN2O15020 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPTBN2O15020 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPTBN2O15020 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPTBN2O15020 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPTBN2O15020 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPTBN2O15020 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPTBN2O15020 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPTBN2O15020 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPTBN2O15020 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPTBN2O15020 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPTBN2O15020 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPTBN2O15020 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPTBN2O15020 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPTBN2O15020 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPTBN2O15020 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SPTBN2O15020 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SPTBN2O15020 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPTBN2O15020 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPTBN2O15020 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPTBN2O15020 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPTBN2O15020 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPTBN2O15020 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPTBN2O15020 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPTBN2O15020 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPTBN2O15020 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPTBN2O15020 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SPTBN2O15020 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPTBN2O15020 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms