Protein–RNA interactions for Protein: O14802

POLR3A, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3AO14802 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
POLR3AO14802 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
POLR3AO14802 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
POLR3AO14802 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
POLR3AO14802 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC35.76■■■■□ 3.31
POLR3AO14802 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.31
POLR3AO14802 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
POLR3AO14802 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
POLR3AO14802 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
POLR3AO14802 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
POLR3AO14802 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
POLR3AO14802 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
POLR3AO14802 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
POLR3AO14802 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
POLR3AO14802 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
POLR3AO14802 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
POLR3AO14802 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC35.71■■■■□ 3.31
POLR3AO14802 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
POLR3AO14802 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
POLR3AO14802 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
POLR3AO14802 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
POLR3AO14802 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC35.69■■■■□ 3.3
POLR3AO14802 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
POLR3AO14802 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
POLR3AO14802 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
POLR3AO14802 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
POLR3AO14802 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
POLR3AO14802 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
POLR3AO14802 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.65■■■■□ 3.3
POLR3AO14802 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
POLR3AO14802 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
POLR3AO14802 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
POLR3AO14802 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
POLR3AO14802 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.64■■■■□ 3.3
POLR3AO14802 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
POLR3AO14802 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
POLR3AO14802 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
POLR3AO14802 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
POLR3AO14802 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
POLR3AO14802 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
POLR3AO14802 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
POLR3AO14802 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC35.6■■■■□ 3.29
POLR3AO14802 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
POLR3AO14802 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
POLR3AO14802 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
POLR3AO14802 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
POLR3AO14802 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC35.57■■■■□ 3.28
POLR3AO14802 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
POLR3AO14802 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
POLR3AO14802 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
POLR3AO14802 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
POLR3AO14802 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
POLR3AO14802 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
POLR3AO14802 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
POLR3AO14802 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
POLR3AO14802 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
POLR3AO14802 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
POLR3AO14802 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC35.51■■■■□ 3.28
POLR3AO14802 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
POLR3AO14802 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC35.51■■■■□ 3.28
POLR3AO14802 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
POLR3AO14802 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
POLR3AO14802 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.27
POLR3AO14802 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.51■■■■□ 3.27
POLR3AO14802 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
POLR3AO14802 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
POLR3AO14802 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
POLR3AO14802 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC35.49■■■■□ 3.27
POLR3AO14802 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC35.49■■■■□ 3.27
POLR3AO14802 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
POLR3AO14802 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
POLR3AO14802 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
POLR3AO14802 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC35.48■■■■□ 3.27
POLR3AO14802 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
POLR3AO14802 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC35.48■■■■□ 3.27
POLR3AO14802 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
POLR3AO14802 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
POLR3AO14802 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
POLR3AO14802 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
POLR3AO14802 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
POLR3AO14802 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
POLR3AO14802 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
POLR3AO14802 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
POLR3AO14802 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
POLR3AO14802 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
POLR3AO14802 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
POLR3AO14802 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
POLR3AO14802 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
POLR3AO14802 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
POLR3AO14802 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
POLR3AO14802 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
POLR3AO14802 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
POLR3AO14802 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
POLR3AO14802 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
POLR3AO14802 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
POLR3AO14802 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
POLR3AO14802 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC35.38■■■■□ 3.26
POLR3AO14802 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
POLR3AO14802 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
POLR3AO14802 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms