Protein–RNA interactions for Protein: O14544

SOCS6, Suppressor of cytokine signaling 6, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS6O14544 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SOCS6O14544 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SOCS6O14544 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SOCS6O14544 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SOCS6O14544 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SOCS6O14544 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SOCS6O14544 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SOCS6O14544 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SOCS6O14544 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SOCS6O14544 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SOCS6O14544 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SOCS6O14544 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SOCS6O14544 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SOCS6O14544 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SOCS6O14544 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SOCS6O14544 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SOCS6O14544 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SOCS6O14544 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SOCS6O14544 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SOCS6O14544 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SOCS6O14544 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SOCS6O14544 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SOCS6O14544 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SOCS6O14544 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SOCS6O14544 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SOCS6O14544 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SOCS6O14544 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SOCS6O14544 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SOCS6O14544 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SOCS6O14544 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SOCS6O14544 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SOCS6O14544 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SOCS6O14544 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SOCS6O14544 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SOCS6O14544 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SOCS6O14544 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SOCS6O14544 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SOCS6O14544 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SOCS6O14544 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SOCS6O14544 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SOCS6O14544 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SOCS6O14544 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SOCS6O14544 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SOCS6O14544 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SOCS6O14544 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SOCS6O14544 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SOCS6O14544 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SOCS6O14544 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SOCS6O14544 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SOCS6O14544 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SOCS6O14544 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SOCS6O14544 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SOCS6O14544 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SOCS6O14544 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SOCS6O14544 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SOCS6O14544 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SOCS6O14544 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOCS6O14544 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOCS6O14544 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SOCS6O14544 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SOCS6O14544 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SOCS6O14544 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SOCS6O14544 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SOCS6O14544 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SOCS6O14544 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SOCS6O14544 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SOCS6O14544 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SOCS6O14544 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SOCS6O14544 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SOCS6O14544 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SOCS6O14544 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SOCS6O14544 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SOCS6O14544 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SOCS6O14544 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SOCS6O14544 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SOCS6O14544 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SOCS6O14544 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SOCS6O14544 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SOCS6O14544 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SOCS6O14544 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SOCS6O14544 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SOCS6O14544 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SOCS6O14544 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SOCS6O14544 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SOCS6O14544 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SOCS6O14544 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SOCS6O14544 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SOCS6O14544 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SOCS6O14544 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SOCS6O14544 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SOCS6O14544 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SOCS6O14544 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SOCS6O14544 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SOCS6O14544 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SOCS6O14544 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SOCS6O14544 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SOCS6O14544 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SOCS6O14544 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SOCS6O14544 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SOCS6O14544 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.5 ms