Protein–RNA interactions for Protein: O00370

LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
O00370 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
O00370 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
O00370 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
O00370 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
O00370 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
O00370 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
O00370 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
O00370 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
O00370 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
O00370 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
O00370 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
O00370 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
O00370 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
O00370 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
O00370 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
O00370 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
O00370 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
O00370 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
O00370 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
O00370 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
O00370 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
O00370 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
O00370 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
O00370 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
O00370 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
O00370 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
O00370 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
O00370 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
O00370 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
O00370 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
O00370 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
O00370 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
O00370 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
O00370 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
O00370 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
O00370 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
O00370 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
O00370 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
O00370 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
O00370 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
O00370 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
O00370 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
O00370 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
O00370 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
O00370 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
O00370 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
O00370 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
O00370 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
O00370 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
O00370 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
O00370 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
O00370 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
O00370 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
O00370 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
O00370 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
O00370 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
O00370 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
O00370 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
O00370 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
O00370 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
O00370 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
O00370 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
O00370 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
O00370 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
O00370 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
O00370 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
O00370 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
O00370 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
O00370 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
O00370 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
O00370 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
O00370 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
O00370 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
O00370 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
O00370 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
O00370 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
O00370 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
O00370 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
O00370 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
O00370 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
O00370 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
O00370 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
O00370 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
O00370 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
O00370 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
O00370 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
O00370 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
O00370 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
O00370 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
O00370 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
O00370 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
O00370 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
O00370 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
O00370 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
O00370 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
O00370 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
O00370 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
O00370 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
O00370 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
O00370 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms