Protein–RNA interactions for Protein: M0QZC1

RNF225, RING finger protein 225, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF225M0QZC1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RNF225M0QZC1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RNF225M0QZC1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RNF225M0QZC1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RNF225M0QZC1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RNF225M0QZC1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RNF225M0QZC1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RNF225M0QZC1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RNF225M0QZC1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RNF225M0QZC1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RNF225M0QZC1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RNF225M0QZC1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RNF225M0QZC1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RNF225M0QZC1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RNF225M0QZC1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RNF225M0QZC1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
RNF225M0QZC1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RNF225M0QZC1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RNF225M0QZC1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RNF225M0QZC1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28■■■□□ 2.07
RNF225M0QZC1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
RNF225M0QZC1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28■■■□□ 2.07
RNF225M0QZC1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28■■■□□ 2.07
RNF225M0QZC1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RNF225M0QZC1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RNF225M0QZC1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RNF225M0QZC1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RNF225M0QZC1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RNF225M0QZC1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RNF225M0QZC1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RNF225M0QZC1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RNF225M0QZC1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RNF225M0QZC1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RNF225M0QZC1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RNF225M0QZC1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
RNF225M0QZC1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RNF225M0QZC1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RNF225M0QZC1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RNF225M0QZC1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RNF225M0QZC1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RNF225M0QZC1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RNF225M0QZC1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RNF225M0QZC1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
RNF225M0QZC1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RNF225M0QZC1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RNF225M0QZC1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RNF225M0QZC1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RNF225M0QZC1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RNF225M0QZC1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RNF225M0QZC1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RNF225M0QZC1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RNF225M0QZC1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RNF225M0QZC1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RNF225M0QZC1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RNF225M0QZC1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RNF225M0QZC1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RNF225M0QZC1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RNF225M0QZC1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RNF225M0QZC1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RNF225M0QZC1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RNF225M0QZC1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RNF225M0QZC1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
RNF225M0QZC1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RNF225M0QZC1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RNF225M0QZC1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RNF225M0QZC1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
RNF225M0QZC1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
RNF225M0QZC1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
RNF225M0QZC1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RNF225M0QZC1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RNF225M0QZC1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
RNF225M0QZC1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RNF225M0QZC1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RNF225M0QZC1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RNF225M0QZC1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RNF225M0QZC1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RNF225M0QZC1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RNF225M0QZC1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RNF225M0QZC1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
RNF225M0QZC1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RNF225M0QZC1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RNF225M0QZC1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RNF225M0QZC1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RNF225M0QZC1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RNF225M0QZC1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RNF225M0QZC1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RNF225M0QZC1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
RNF225M0QZC1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RNF225M0QZC1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RNF225M0QZC1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RNF225M0QZC1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RNF225M0QZC1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RNF225M0QZC1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RNF225M0QZC1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RNF225M0QZC1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RNF225M0QZC1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RNF225M0QZC1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
RNF225M0QZC1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RNF225M0QZC1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RNF225M0QZC1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms