Protein–RNA interactions for Protein: J3KT08

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KT08 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
J3KT08 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
J3KT08 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
J3KT08 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
J3KT08 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
J3KT08 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
J3KT08 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
J3KT08 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
J3KT08 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
J3KT08 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
J3KT08 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
J3KT08 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
J3KT08 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
J3KT08 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
J3KT08 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
J3KT08 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
J3KT08 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
J3KT08 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
J3KT08 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
J3KT08 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
J3KT08 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
J3KT08 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
J3KT08 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
J3KT08 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
J3KT08 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
J3KT08 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
J3KT08 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
J3KT08 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
J3KT08 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
J3KT08 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
J3KT08 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
J3KT08 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
J3KT08 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
J3KT08 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
J3KT08 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
J3KT08 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
J3KT08 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
J3KT08 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
J3KT08 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
J3KT08 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
J3KT08 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
J3KT08 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
J3KT08 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
J3KT08 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
J3KT08 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
J3KT08 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
J3KT08 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
J3KT08 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
J3KT08 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
J3KT08 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
J3KT08 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
J3KT08 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
J3KT08 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
J3KT08 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
J3KT08 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
J3KT08 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
J3KT08 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
J3KT08 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
J3KT08 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
J3KT08 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
J3KT08 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
J3KT08 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
J3KT08 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
J3KT08 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
J3KT08 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
J3KT08 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
J3KT08 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
J3KT08 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
J3KT08 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
J3KT08 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
J3KT08 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
J3KT08 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
J3KT08 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
J3KT08 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
J3KT08 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
J3KT08 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
J3KT08 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
J3KT08 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
J3KT08 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
J3KT08 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
J3KT08 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
J3KT08 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
J3KT08 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
J3KT08 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
J3KT08 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
J3KT08 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
J3KT08 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
J3KT08 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
J3KT08 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
J3KT08 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
J3KT08 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
J3KT08 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
J3KT08 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
J3KT08 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
J3KT08 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
J3KT08 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
J3KT08 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
J3KT08 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
J3KT08 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
J3KT08 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms