Protein–RNA interactions for Protein: H7C1Q1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1Q1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H7C1Q1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
H7C1Q1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
H7C1Q1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
H7C1Q1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
H7C1Q1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
H7C1Q1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
H7C1Q1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
H7C1Q1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
H7C1Q1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
H7C1Q1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H7C1Q1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
H7C1Q1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H7C1Q1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H7C1Q1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H7C1Q1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H7C1Q1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
H7C1Q1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
H7C1Q1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H7C1Q1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
H7C1Q1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H7C1Q1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
H7C1Q1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
H7C1Q1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H7C1Q1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H7C1Q1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
H7C1Q1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H7C1Q1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
H7C1Q1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
H7C1Q1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
H7C1Q1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H7C1Q1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
H7C1Q1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
H7C1Q1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
H7C1Q1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
H7C1Q1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
H7C1Q1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
H7C1Q1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
H7C1Q1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
H7C1Q1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
H7C1Q1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
H7C1Q1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
H7C1Q1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
H7C1Q1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
H7C1Q1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H7C1Q1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
H7C1Q1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
H7C1Q1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H7C1Q1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H7C1Q1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
H7C1Q1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
H7C1Q1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H7C1Q1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H7C1Q1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H7C1Q1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H7C1Q1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H7C1Q1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H7C1Q1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H7C1Q1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H7C1Q1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H7C1Q1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
H7C1Q1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H7C1Q1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
H7C1Q1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H7C1Q1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
H7C1Q1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H7C1Q1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H7C1Q1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H7C1Q1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
H7C1Q1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
H7C1Q1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
H7C1Q1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
H7C1Q1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
H7C1Q1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H7C1Q1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
H7C1Q1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H7C1Q1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
H7C1Q1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H7C1Q1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H7C1Q1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
H7C1Q1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
H7C1Q1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
H7C1Q1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
H7C1Q1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
H7C1Q1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
H7C1Q1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
H7C1Q1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
H7C1Q1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
H7C1Q1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
H7C1Q1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
H7C1Q1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
H7C1Q1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
H7C1Q1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
H7C1Q1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H7C1Q1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H7C1Q1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H7C1Q1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H7C1Q1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H7C1Q1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H7C1Q1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
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