Protein–RNA interactions for Protein: H7C1D1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1D1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
H7C1D1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
H7C1D1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC31.29■■■□□ 2.6
H7C1D1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
H7C1D1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
H7C1D1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
H7C1D1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
H7C1D1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
H7C1D1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC31.28■■■□□ 2.6
H7C1D1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC31.28■■■□□ 2.6
H7C1D1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
H7C1D1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
H7C1D1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
H7C1D1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
H7C1D1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
H7C1D1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
H7C1D1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
H7C1D1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
H7C1D1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
H7C1D1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
H7C1D1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
H7C1D1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
H7C1D1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
H7C1D1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
H7C1D1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
H7C1D1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
H7C1D1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
H7C1D1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
H7C1D1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
H7C1D1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
H7C1D1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
H7C1D1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
H7C1D1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC31.18■■■□□ 2.58
H7C1D1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
H7C1D1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
H7C1D1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
H7C1D1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
H7C1D1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
H7C1D1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
H7C1D1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
H7C1D1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
H7C1D1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
H7C1D1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
H7C1D1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
H7C1D1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
H7C1D1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
H7C1D1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
H7C1D1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
H7C1D1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
H7C1D1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
H7C1D1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
H7C1D1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
H7C1D1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
H7C1D1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
H7C1D1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
H7C1D1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
H7C1D1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
H7C1D1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
H7C1D1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
H7C1D1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
H7C1D1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
H7C1D1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
H7C1D1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
H7C1D1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
H7C1D1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
H7C1D1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
H7C1D1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
H7C1D1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
H7C1D1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
H7C1D1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
H7C1D1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
H7C1D1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
H7C1D1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
H7C1D1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
H7C1D1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
H7C1D1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
H7C1D1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
H7C1D1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
H7C1D1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
H7C1D1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
H7C1D1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
H7C1D1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
H7C1D1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
H7C1D1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
H7C1D1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
H7C1D1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
H7C1D1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
H7C1D1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC31.01■■■□□ 2.55
H7C1D1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
H7C1D1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
H7C1D1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
H7C1D1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
H7C1D1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.99■■■□□ 2.55
H7C1D1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
H7C1D1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
H7C1D1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
H7C1D1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
H7C1D1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
H7C1D1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
H7C1D1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms