Protein–RNA interactions for Protein: H3BRM9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BRM9 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
H3BRM9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H3BRM9 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
H3BRM9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H3BRM9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H3BRM9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H3BRM9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H3BRM9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H3BRM9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H3BRM9 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H3BRM9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H3BRM9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H3BRM9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
H3BRM9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
H3BRM9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H3BRM9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H3BRM9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H3BRM9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
H3BRM9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
H3BRM9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
H3BRM9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H3BRM9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
H3BRM9 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
H3BRM9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H3BRM9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H3BRM9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H3BRM9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
H3BRM9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
H3BRM9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H3BRM9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
H3BRM9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
H3BRM9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
H3BRM9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H3BRM9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H3BRM9 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
H3BRM9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
H3BRM9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
H3BRM9 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
H3BRM9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
H3BRM9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
H3BRM9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
H3BRM9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
H3BRM9 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H3BRM9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
H3BRM9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
H3BRM9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H3BRM9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
H3BRM9 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
H3BRM9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H3BRM9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H3BRM9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H3BRM9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H3BRM9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H3BRM9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H3BRM9 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
H3BRM9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
H3BRM9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
H3BRM9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H3BRM9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H3BRM9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H3BRM9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H3BRM9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H3BRM9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H3BRM9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H3BRM9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H3BRM9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
H3BRM9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
H3BRM9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
H3BRM9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
H3BRM9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H3BRM9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
H3BRM9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
H3BRM9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H3BRM9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
H3BRM9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
H3BRM9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H3BRM9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H3BRM9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H3BRM9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H3BRM9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H3BRM9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H3BRM9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H3BRM9 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
H3BRM9 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H3BRM9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H3BRM9 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H3BRM9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
H3BRM9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H3BRM9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H3BRM9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H3BRM9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
H3BRM9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
H3BRM9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H3BRM9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
H3BRM9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H3BRM9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H3BRM9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H3BRM9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
H3BRM9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H3BRM9 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms