Protein–RNA interactions for Protein: F8VVB4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8VVB4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
F8VVB4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
F8VVB4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
F8VVB4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
F8VVB4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
F8VVB4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
F8VVB4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
F8VVB4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
F8VVB4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
F8VVB4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
F8VVB4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
F8VVB4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
F8VVB4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
F8VVB4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
F8VVB4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
F8VVB4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
F8VVB4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
F8VVB4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
F8VVB4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
F8VVB4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
F8VVB4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
F8VVB4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
F8VVB4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
F8VVB4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
F8VVB4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
F8VVB4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
F8VVB4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
F8VVB4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
F8VVB4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
F8VVB4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
F8VVB4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
F8VVB4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
F8VVB4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
F8VVB4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
F8VVB4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
F8VVB4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
F8VVB4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
F8VVB4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
F8VVB4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
F8VVB4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
F8VVB4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
F8VVB4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
F8VVB4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
F8VVB4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
F8VVB4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
F8VVB4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
F8VVB4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
F8VVB4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
F8VVB4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
F8VVB4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
F8VVB4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
F8VVB4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
F8VVB4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
F8VVB4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
F8VVB4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
F8VVB4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
F8VVB4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
F8VVB4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
F8VVB4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
F8VVB4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
F8VVB4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
F8VVB4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
F8VVB4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
F8VVB4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
F8VVB4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
F8VVB4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
F8VVB4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
F8VVB4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
F8VVB4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
F8VVB4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
F8VVB4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
F8VVB4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
F8VVB4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
F8VVB4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
F8VVB4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
F8VVB4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
F8VVB4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
F8VVB4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
F8VVB4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
F8VVB4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
F8VVB4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
F8VVB4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
F8VVB4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
F8VVB4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
F8VVB4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
F8VVB4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
F8VVB4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
F8VVB4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
F8VVB4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
F8VVB4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
F8VVB4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
F8VVB4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
F8VVB4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
F8VVB4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
F8VVB4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
F8VVB4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
F8VVB4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
F8VVB4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
F8VVB4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
F8VVB4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms