Protein–RNA interactions for Protein: C9J366

IQCJ-SCHIP1, IQCJ-SCHIP1 readthrough, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IQCJ-SCHIP1C9J366 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
IQCJ-SCHIP1C9J366 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
IQCJ-SCHIP1C9J366 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IQCJ-SCHIP1C9J366 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IQCJ-SCHIP1C9J366 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IQCJ-SCHIP1C9J366 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
IQCJ-SCHIP1C9J366 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
IQCJ-SCHIP1C9J366 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
IQCJ-SCHIP1C9J366 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
IQCJ-SCHIP1C9J366 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
IQCJ-SCHIP1C9J366 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
IQCJ-SCHIP1C9J366 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
IQCJ-SCHIP1C9J366 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IQCJ-SCHIP1C9J366 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IQCJ-SCHIP1C9J366 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IQCJ-SCHIP1C9J366 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IQCJ-SCHIP1C9J366 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
IQCJ-SCHIP1C9J366 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IQCJ-SCHIP1C9J366 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IQCJ-SCHIP1C9J366 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IQCJ-SCHIP1C9J366 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
IQCJ-SCHIP1C9J366 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
IQCJ-SCHIP1C9J366 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IQCJ-SCHIP1C9J366 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IQCJ-SCHIP1C9J366 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IQCJ-SCHIP1C9J366 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IQCJ-SCHIP1C9J366 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IQCJ-SCHIP1C9J366 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IQCJ-SCHIP1C9J366 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IQCJ-SCHIP1C9J366 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IQCJ-SCHIP1C9J366 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IQCJ-SCHIP1C9J366 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IQCJ-SCHIP1C9J366 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IQCJ-SCHIP1C9J366 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IQCJ-SCHIP1C9J366 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IQCJ-SCHIP1C9J366 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IQCJ-SCHIP1C9J366 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IQCJ-SCHIP1C9J366 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IQCJ-SCHIP1C9J366 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
IQCJ-SCHIP1C9J366 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IQCJ-SCHIP1C9J366 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IQCJ-SCHIP1C9J366 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IQCJ-SCHIP1C9J366 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IQCJ-SCHIP1C9J366 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IQCJ-SCHIP1C9J366 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IQCJ-SCHIP1C9J366 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IQCJ-SCHIP1C9J366 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
IQCJ-SCHIP1C9J366 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IQCJ-SCHIP1C9J366 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IQCJ-SCHIP1C9J366 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IQCJ-SCHIP1C9J366 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IQCJ-SCHIP1C9J366 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IQCJ-SCHIP1C9J366 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IQCJ-SCHIP1C9J366 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IQCJ-SCHIP1C9J366 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IQCJ-SCHIP1C9J366 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IQCJ-SCHIP1C9J366 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
IQCJ-SCHIP1C9J366 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
IQCJ-SCHIP1C9J366 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IQCJ-SCHIP1C9J366 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
IQCJ-SCHIP1C9J366 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IQCJ-SCHIP1C9J366 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
IQCJ-SCHIP1C9J366 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IQCJ-SCHIP1C9J366 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IQCJ-SCHIP1C9J366 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
IQCJ-SCHIP1C9J366 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
IQCJ-SCHIP1C9J366 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
IQCJ-SCHIP1C9J366 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IQCJ-SCHIP1C9J366 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IQCJ-SCHIP1C9J366 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
IQCJ-SCHIP1C9J366 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IQCJ-SCHIP1C9J366 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
IQCJ-SCHIP1C9J366 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IQCJ-SCHIP1C9J366 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IQCJ-SCHIP1C9J366 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IQCJ-SCHIP1C9J366 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IQCJ-SCHIP1C9J366 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IQCJ-SCHIP1C9J366 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
IQCJ-SCHIP1C9J366 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
IQCJ-SCHIP1C9J366 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IQCJ-SCHIP1C9J366 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IQCJ-SCHIP1C9J366 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
IQCJ-SCHIP1C9J366 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
IQCJ-SCHIP1C9J366 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IQCJ-SCHIP1C9J366 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IQCJ-SCHIP1C9J366 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
IQCJ-SCHIP1C9J366 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IQCJ-SCHIP1C9J366 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IQCJ-SCHIP1C9J366 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IQCJ-SCHIP1C9J366 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IQCJ-SCHIP1C9J366 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IQCJ-SCHIP1C9J366 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms