Protein–RNA interactions for Protein: B1AHC4

PRR5-ARHGAP8, PRR5-ARHGAP8 readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.8 ms