Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KNCNA6PVL3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KNCNA6PVL3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KNCNA6PVL3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KNCNA6PVL3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KNCNA6PVL3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KNCNA6PVL3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KNCNA6PVL3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KNCNA6PVL3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KNCNA6PVL3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KNCNA6PVL3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KNCNA6PVL3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
KNCNA6PVL3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KNCNA6PVL3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KNCNA6PVL3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KNCNA6PVL3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KNCNA6PVL3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KNCNA6PVL3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KNCNA6PVL3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
KNCNA6PVL3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KNCNA6PVL3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
KNCNA6PVL3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
KNCNA6PVL3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KNCNA6PVL3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KNCNA6PVL3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
KNCNA6PVL3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KNCNA6PVL3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KNCNA6PVL3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KNCNA6PVL3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KNCNA6PVL3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KNCNA6PVL3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
KNCNA6PVL3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KNCNA6PVL3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KNCNA6PVL3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KNCNA6PVL3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KNCNA6PVL3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KNCNA6PVL3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KNCNA6PVL3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KNCNA6PVL3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KNCNA6PVL3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KNCNA6PVL3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KNCNA6PVL3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KNCNA6PVL3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KNCNA6PVL3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KNCNA6PVL3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KNCNA6PVL3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KNCNA6PVL3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KNCNA6PVL3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KNCNA6PVL3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
KNCNA6PVL3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KNCNA6PVL3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KNCNA6PVL3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KNCNA6PVL3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KNCNA6PVL3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KNCNA6PVL3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KNCNA6PVL3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KNCNA6PVL3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KNCNA6PVL3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KNCNA6PVL3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KNCNA6PVL3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KNCNA6PVL3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KNCNA6PVL3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
KNCNA6PVL3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
KNCNA6PVL3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
KNCNA6PVL3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KNCNA6PVL3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KNCNA6PVL3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KNCNA6PVL3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KNCNA6PVL3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
KNCNA6PVL3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KNCNA6PVL3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KNCNA6PVL3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
KNCNA6PVL3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
KNCNA6PVL3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KNCNA6PVL3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
KNCNA6PVL3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KNCNA6PVL3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC19■□□□□ 0.63
KNCNA6PVL3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KNCNA6PVL3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
KNCNA6PVL3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KNCNA6PVL3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KNCNA6PVL3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KNCNA6PVL3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KNCNA6PVL3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
KNCNA6PVL3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
KNCNA6PVL3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KNCNA6PVL3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KNCNA6PVL3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KNCNA6PVL3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KNCNA6PVL3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KNCNA6PVL3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KNCNA6PVL3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KNCNA6PVL3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KNCNA6PVL3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KNCNA6PVL3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KNCNA6PVL3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KNCNA6PVL3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KNCNA6PVL3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KNCNA6PVL3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KNCNA6PVL3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms