Protein–RNA interactions for Protein: A6NK58

LIPT2, Putative lipoyltransferase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPT2A6NK58 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LIPT2A6NK58 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LIPT2A6NK58 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LIPT2A6NK58 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LIPT2A6NK58 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LIPT2A6NK58 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LIPT2A6NK58 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LIPT2A6NK58 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LIPT2A6NK58 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LIPT2A6NK58 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LIPT2A6NK58 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LIPT2A6NK58 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LIPT2A6NK58 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LIPT2A6NK58 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LIPT2A6NK58 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LIPT2A6NK58 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LIPT2A6NK58 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LIPT2A6NK58 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LIPT2A6NK58 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LIPT2A6NK58 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LIPT2A6NK58 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LIPT2A6NK58 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
LIPT2A6NK58 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LIPT2A6NK58 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LIPT2A6NK58 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
LIPT2A6NK58 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LIPT2A6NK58 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LIPT2A6NK58 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LIPT2A6NK58 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LIPT2A6NK58 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LIPT2A6NK58 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LIPT2A6NK58 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LIPT2A6NK58 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LIPT2A6NK58 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LIPT2A6NK58 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LIPT2A6NK58 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LIPT2A6NK58 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LIPT2A6NK58 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LIPT2A6NK58 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LIPT2A6NK58 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LIPT2A6NK58 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LIPT2A6NK58 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LIPT2A6NK58 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LIPT2A6NK58 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LIPT2A6NK58 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LIPT2A6NK58 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LIPT2A6NK58 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LIPT2A6NK58 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LIPT2A6NK58 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
LIPT2A6NK58 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LIPT2A6NK58 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LIPT2A6NK58 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
LIPT2A6NK58 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LIPT2A6NK58 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LIPT2A6NK58 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LIPT2A6NK58 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LIPT2A6NK58 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LIPT2A6NK58 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LIPT2A6NK58 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LIPT2A6NK58 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LIPT2A6NK58 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LIPT2A6NK58 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LIPT2A6NK58 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LIPT2A6NK58 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LIPT2A6NK58 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LIPT2A6NK58 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
LIPT2A6NK58 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LIPT2A6NK58 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LIPT2A6NK58 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LIPT2A6NK58 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LIPT2A6NK58 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LIPT2A6NK58 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LIPT2A6NK58 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LIPT2A6NK58 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LIPT2A6NK58 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LIPT2A6NK58 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LIPT2A6NK58 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LIPT2A6NK58 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LIPT2A6NK58 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LIPT2A6NK58 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LIPT2A6NK58 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LIPT2A6NK58 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LIPT2A6NK58 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LIPT2A6NK58 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LIPT2A6NK58 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LIPT2A6NK58 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LIPT2A6NK58 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LIPT2A6NK58 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LIPT2A6NK58 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LIPT2A6NK58 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LIPT2A6NK58 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LIPT2A6NK58 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LIPT2A6NK58 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LIPT2A6NK58 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LIPT2A6NK58 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LIPT2A6NK58 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
LIPT2A6NK58 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LIPT2A6NK58 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LIPT2A6NK58 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LIPT2A6NK58 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms