Protein–RNA interactions for Protein: A6NK53

ZNF233, Zinc finger protein 233, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF233A6NK53 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZNF233A6NK53 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZNF233A6NK53 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZNF233A6NK53 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
ZNF233A6NK53 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZNF233A6NK53 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
ZNF233A6NK53 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZNF233A6NK53 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZNF233A6NK53 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZNF233A6NK53 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZNF233A6NK53 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZNF233A6NK53 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZNF233A6NK53 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZNF233A6NK53 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZNF233A6NK53 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZNF233A6NK53 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZNF233A6NK53 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZNF233A6NK53 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZNF233A6NK53 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZNF233A6NK53 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ZNF233A6NK53 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28■■■□□ 2.07
ZNF233A6NK53 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ZNF233A6NK53 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ZNF233A6NK53 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28■■■□□ 2.07
ZNF233A6NK53 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZNF233A6NK53 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZNF233A6NK53 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZNF233A6NK53 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZNF233A6NK53 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZNF233A6NK53 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZNF233A6NK53 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZNF233A6NK53 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZNF233A6NK53 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZNF233A6NK53 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZNF233A6NK53 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZNF233A6NK53 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZNF233A6NK53 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ZNF233A6NK53 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ZNF233A6NK53 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ZNF233A6NK53 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ZNF233A6NK53 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ZNF233A6NK53 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZNF233A6NK53 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZNF233A6NK53 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZNF233A6NK53 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZNF233A6NK53 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZNF233A6NK53 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZNF233A6NK53 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
ZNF233A6NK53 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZNF233A6NK53 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZNF233A6NK53 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZNF233A6NK53 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZNF233A6NK53 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZNF233A6NK53 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZNF233A6NK53 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
ZNF233A6NK53 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
ZNF233A6NK53 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
ZNF233A6NK53 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZNF233A6NK53 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZNF233A6NK53 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZNF233A6NK53 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZNF233A6NK53 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZNF233A6NK53 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZNF233A6NK53 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZNF233A6NK53 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZNF233A6NK53 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZNF233A6NK53 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZNF233A6NK53 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZNF233A6NK53 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZNF233A6NK53 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZNF233A6NK53 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZNF233A6NK53 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZNF233A6NK53 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZNF233A6NK53 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZNF233A6NK53 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZNF233A6NK53 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZNF233A6NK53 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZNF233A6NK53 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
ZNF233A6NK53 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
ZNF233A6NK53 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
ZNF233A6NK53 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZNF233A6NK53 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZNF233A6NK53 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZNF233A6NK53 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZNF233A6NK53 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZNF233A6NK53 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZNF233A6NK53 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZNF233A6NK53 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZNF233A6NK53 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZNF233A6NK53 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZNF233A6NK53 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZNF233A6NK53 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZNF233A6NK53 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
ZNF233A6NK53 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZNF233A6NK53 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZNF233A6NK53 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ZNF233A6NK53 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ZNF233A6NK53 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ZNF233A6NK53 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ZNF233A6NK53 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms