Protein–RNA interactions for Protein: A6NIR3

AGAP5, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP5A6NIR3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
AGAP5A6NIR3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
AGAP5A6NIR3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
AGAP5A6NIR3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AGAP5A6NIR3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AGAP5A6NIR3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
AGAP5A6NIR3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AGAP5A6NIR3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
AGAP5A6NIR3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AGAP5A6NIR3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AGAP5A6NIR3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
AGAP5A6NIR3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AGAP5A6NIR3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
AGAP5A6NIR3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
AGAP5A6NIR3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
AGAP5A6NIR3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
AGAP5A6NIR3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
AGAP5A6NIR3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AGAP5A6NIR3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
AGAP5A6NIR3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
AGAP5A6NIR3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
AGAP5A6NIR3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
AGAP5A6NIR3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
AGAP5A6NIR3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
AGAP5A6NIR3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AGAP5A6NIR3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AGAP5A6NIR3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
AGAP5A6NIR3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AGAP5A6NIR3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AGAP5A6NIR3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AGAP5A6NIR3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AGAP5A6NIR3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AGAP5A6NIR3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AGAP5A6NIR3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AGAP5A6NIR3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AGAP5A6NIR3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AGAP5A6NIR3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AGAP5A6NIR3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
AGAP5A6NIR3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AGAP5A6NIR3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AGAP5A6NIR3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
AGAP5A6NIR3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AGAP5A6NIR3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AGAP5A6NIR3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AGAP5A6NIR3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AGAP5A6NIR3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AGAP5A6NIR3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AGAP5A6NIR3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AGAP5A6NIR3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AGAP5A6NIR3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AGAP5A6NIR3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AGAP5A6NIR3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AGAP5A6NIR3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
AGAP5A6NIR3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
AGAP5A6NIR3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AGAP5A6NIR3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
AGAP5A6NIR3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AGAP5A6NIR3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AGAP5A6NIR3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
AGAP5A6NIR3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AGAP5A6NIR3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AGAP5A6NIR3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
AGAP5A6NIR3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AGAP5A6NIR3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
AGAP5A6NIR3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
AGAP5A6NIR3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AGAP5A6NIR3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
AGAP5A6NIR3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
AGAP5A6NIR3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AGAP5A6NIR3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
AGAP5A6NIR3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
AGAP5A6NIR3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AGAP5A6NIR3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
AGAP5A6NIR3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
AGAP5A6NIR3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
AGAP5A6NIR3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
AGAP5A6NIR3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AGAP5A6NIR3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
AGAP5A6NIR3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
AGAP5A6NIR3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AGAP5A6NIR3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AGAP5A6NIR3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AGAP5A6NIR3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AGAP5A6NIR3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
AGAP5A6NIR3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
AGAP5A6NIR3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
AGAP5A6NIR3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AGAP5A6NIR3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AGAP5A6NIR3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
AGAP5A6NIR3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
AGAP5A6NIR3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AGAP5A6NIR3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AGAP5A6NIR3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AGAP5A6NIR3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AGAP5A6NIR3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AGAP5A6NIR3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AGAP5A6NIR3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AGAP5A6NIR3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
AGAP5A6NIR3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AGAP5A6NIR3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms