Protein–RNA interactions for Protein: A6NH21

SERINC4, Serine incorporator 4, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC4A6NH21 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SERINC4A6NH21 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SERINC4A6NH21 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SERINC4A6NH21 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SERINC4A6NH21 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SERINC4A6NH21 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SERINC4A6NH21 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SERINC4A6NH21 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SERINC4A6NH21 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SERINC4A6NH21 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SERINC4A6NH21 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SERINC4A6NH21 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SERINC4A6NH21 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SERINC4A6NH21 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SERINC4A6NH21 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SERINC4A6NH21 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SERINC4A6NH21 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SERINC4A6NH21 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SERINC4A6NH21 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SERINC4A6NH21 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SERINC4A6NH21 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SERINC4A6NH21 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SERINC4A6NH21 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SERINC4A6NH21 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SERINC4A6NH21 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SERINC4A6NH21 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SERINC4A6NH21 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SERINC4A6NH21 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SERINC4A6NH21 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SERINC4A6NH21 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SERINC4A6NH21 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SERINC4A6NH21 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SERINC4A6NH21 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SERINC4A6NH21 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SERINC4A6NH21 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SERINC4A6NH21 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SERINC4A6NH21 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SERINC4A6NH21 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SERINC4A6NH21 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SERINC4A6NH21 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SERINC4A6NH21 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SERINC4A6NH21 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SERINC4A6NH21 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SERINC4A6NH21 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SERINC4A6NH21 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SERINC4A6NH21 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SERINC4A6NH21 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SERINC4A6NH21 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SERINC4A6NH21 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SERINC4A6NH21 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SERINC4A6NH21 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SERINC4A6NH21 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SERINC4A6NH21 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SERINC4A6NH21 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SERINC4A6NH21 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SERINC4A6NH21 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SERINC4A6NH21 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SERINC4A6NH21 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SERINC4A6NH21 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SERINC4A6NH21 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SERINC4A6NH21 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SERINC4A6NH21 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SERINC4A6NH21 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SERINC4A6NH21 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SERINC4A6NH21 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SERINC4A6NH21 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SERINC4A6NH21 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SERINC4A6NH21 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SERINC4A6NH21 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SERINC4A6NH21 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SERINC4A6NH21 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SERINC4A6NH21 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SERINC4A6NH21 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SERINC4A6NH21 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SERINC4A6NH21 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SERINC4A6NH21 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SERINC4A6NH21 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SERINC4A6NH21 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SERINC4A6NH21 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SERINC4A6NH21 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SERINC4A6NH21 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SERINC4A6NH21 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SERINC4A6NH21 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SERINC4A6NH21 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SERINC4A6NH21 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SERINC4A6NH21 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SERINC4A6NH21 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SERINC4A6NH21 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SERINC4A6NH21 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SERINC4A6NH21 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SERINC4A6NH21 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SERINC4A6NH21 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SERINC4A6NH21 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SERINC4A6NH21 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SERINC4A6NH21 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SERINC4A6NH21 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SERINC4A6NH21 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SERINC4A6NH21 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SERINC4A6NH21 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SERINC4A6NH21 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms