Protein–RNA interactions for Protein: A6NFY4

NEMP2, Nuclear envelope integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMP2A6NFY4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NEMP2A6NFY4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NEMP2A6NFY4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NEMP2A6NFY4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NEMP2A6NFY4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NEMP2A6NFY4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NEMP2A6NFY4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NEMP2A6NFY4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEMP2A6NFY4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEMP2A6NFY4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
NEMP2A6NFY4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEMP2A6NFY4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEMP2A6NFY4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEMP2A6NFY4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEMP2A6NFY4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEMP2A6NFY4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEMP2A6NFY4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
NEMP2A6NFY4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEMP2A6NFY4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEMP2A6NFY4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEMP2A6NFY4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
NEMP2A6NFY4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NEMP2A6NFY4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NEMP2A6NFY4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NEMP2A6NFY4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NEMP2A6NFY4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEMP2A6NFY4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEMP2A6NFY4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEMP2A6NFY4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEMP2A6NFY4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEMP2A6NFY4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEMP2A6NFY4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEMP2A6NFY4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEMP2A6NFY4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
NEMP2A6NFY4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEMP2A6NFY4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEMP2A6NFY4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEMP2A6NFY4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEMP2A6NFY4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEMP2A6NFY4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEMP2A6NFY4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEMP2A6NFY4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEMP2A6NFY4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEMP2A6NFY4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NEMP2A6NFY4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NEMP2A6NFY4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NEMP2A6NFY4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NEMP2A6NFY4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NEMP2A6NFY4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NEMP2A6NFY4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NEMP2A6NFY4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NEMP2A6NFY4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NEMP2A6NFY4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEMP2A6NFY4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEMP2A6NFY4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEMP2A6NFY4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEMP2A6NFY4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEMP2A6NFY4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEMP2A6NFY4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEMP2A6NFY4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEMP2A6NFY4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEMP2A6NFY4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEMP2A6NFY4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEMP2A6NFY4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEMP2A6NFY4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEMP2A6NFY4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NEMP2A6NFY4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NEMP2A6NFY4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NEMP2A6NFY4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NEMP2A6NFY4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NEMP2A6NFY4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NEMP2A6NFY4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NEMP2A6NFY4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NEMP2A6NFY4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEMP2A6NFY4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEMP2A6NFY4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEMP2A6NFY4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEMP2A6NFY4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEMP2A6NFY4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEMP2A6NFY4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEMP2A6NFY4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEMP2A6NFY4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEMP2A6NFY4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NEMP2A6NFY4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NEMP2A6NFY4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NEMP2A6NFY4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NEMP2A6NFY4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NEMP2A6NFY4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NEMP2A6NFY4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEMP2A6NFY4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
NEMP2A6NFY4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEMP2A6NFY4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEMP2A6NFY4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEMP2A6NFY4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEMP2A6NFY4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEMP2A6NFY4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
NEMP2A6NFY4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEMP2A6NFY4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEMP2A6NFY4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEMP2A6NFY4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms