Protein–RNA interactions for Protein: A6NCN2

KRT87P, Putative keratin-87 protein, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT87PA6NCN2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT87PA6NCN2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT87PA6NCN2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT87PA6NCN2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT87PA6NCN2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT87PA6NCN2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT87PA6NCN2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT87PA6NCN2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT87PA6NCN2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT87PA6NCN2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT87PA6NCN2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT87PA6NCN2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT87PA6NCN2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT87PA6NCN2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT87PA6NCN2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT87PA6NCN2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT87PA6NCN2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT87PA6NCN2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT87PA6NCN2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT87PA6NCN2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT87PA6NCN2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT87PA6NCN2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KRT87PA6NCN2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
KRT87PA6NCN2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KRT87PA6NCN2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
KRT87PA6NCN2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
KRT87PA6NCN2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT87PA6NCN2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT87PA6NCN2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT87PA6NCN2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT87PA6NCN2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT87PA6NCN2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT87PA6NCN2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT87PA6NCN2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT87PA6NCN2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT87PA6NCN2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT87PA6NCN2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT87PA6NCN2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT87PA6NCN2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT87PA6NCN2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT87PA6NCN2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT87PA6NCN2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT87PA6NCN2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT87PA6NCN2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT87PA6NCN2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT87PA6NCN2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT87PA6NCN2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT87PA6NCN2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT87PA6NCN2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT87PA6NCN2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT87PA6NCN2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT87PA6NCN2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT87PA6NCN2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT87PA6NCN2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT87PA6NCN2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT87PA6NCN2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT87PA6NCN2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KRT87PA6NCN2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KRT87PA6NCN2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
KRT87PA6NCN2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRT87PA6NCN2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT87PA6NCN2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT87PA6NCN2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT87PA6NCN2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT87PA6NCN2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT87PA6NCN2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT87PA6NCN2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT87PA6NCN2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT87PA6NCN2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT87PA6NCN2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT87PA6NCN2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT87PA6NCN2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT87PA6NCN2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT87PA6NCN2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT87PA6NCN2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT87PA6NCN2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT87PA6NCN2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT87PA6NCN2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT87PA6NCN2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT87PA6NCN2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT87PA6NCN2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT87PA6NCN2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
KRT87PA6NCN2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT87PA6NCN2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT87PA6NCN2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT87PA6NCN2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT87PA6NCN2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT87PA6NCN2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT87PA6NCN2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT87PA6NCN2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT87PA6NCN2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT87PA6NCN2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT87PA6NCN2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT87PA6NCN2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT87PA6NCN2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT87PA6NCN2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT87PA6NCN2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT87PA6NCN2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT87PA6NCN2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT87PA6NCN2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms