Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
PSDA5PKW4 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
PSDA5PKW4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
PSDA5PKW4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
PSDA5PKW4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
PSDA5PKW4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
PSDA5PKW4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PSDA5PKW4 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
PSDA5PKW4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
PSDA5PKW4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
PSDA5PKW4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
PSDA5PKW4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
PSDA5PKW4 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
PSDA5PKW4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
PSDA5PKW4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
PSDA5PKW4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
PSDA5PKW4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
PSDA5PKW4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
PSDA5PKW4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
PSDA5PKW4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
PSDA5PKW4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
PSDA5PKW4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
PSDA5PKW4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
PSDA5PKW4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC33.54■■■□□ 2.96
PSDA5PKW4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
PSDA5PKW4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
PSDA5PKW4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
PSDA5PKW4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
PSDA5PKW4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
PSDA5PKW4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
PSDA5PKW4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.95
PSDA5PKW4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
PSDA5PKW4 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
PSDA5PKW4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
PSDA5PKW4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
PSDA5PKW4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
PSDA5PKW4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
PSDA5PKW4 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
PSDA5PKW4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
PSDA5PKW4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
PSDA5PKW4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
PSDA5PKW4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
PSDA5PKW4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
PSDA5PKW4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
PSDA5PKW4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
PSDA5PKW4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
PSDA5PKW4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
PSDA5PKW4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
PSDA5PKW4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
PSDA5PKW4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
PSDA5PKW4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
PSDA5PKW4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
PSDA5PKW4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
PSDA5PKW4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
PSDA5PKW4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
PSDA5PKW4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
PSDA5PKW4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
PSDA5PKW4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
PSDA5PKW4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
PSDA5PKW4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
PSDA5PKW4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
PSDA5PKW4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
PSDA5PKW4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
PSDA5PKW4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
PSDA5PKW4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
PSDA5PKW4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
PSDA5PKW4 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
PSDA5PKW4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
PSDA5PKW4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
PSDA5PKW4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
PSDA5PKW4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
PSDA5PKW4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
PSDA5PKW4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
PSDA5PKW4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
PSDA5PKW4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
PSDA5PKW4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
PSDA5PKW4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
PSDA5PKW4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
PSDA5PKW4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
PSDA5PKW4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC33.34■■■□□ 2.93
PSDA5PKW4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
PSDA5PKW4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
PSDA5PKW4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
PSDA5PKW4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
PSDA5PKW4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
PSDA5PKW4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
PSDA5PKW4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
PSDA5PKW4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
PSDA5PKW4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
PSDA5PKW4 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
PSDA5PKW4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
PSDA5PKW4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
PSDA5PKW4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
PSDA5PKW4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
PSDA5PKW4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
PSDA5PKW4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
PSDA5PKW4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
PSDA5PKW4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
PSDA5PKW4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
PSDA5PKW4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms