Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
PTPDC1A2A3K4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PTPDC1A2A3K4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
PTPDC1A2A3K4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PTPDC1A2A3K4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PTPDC1A2A3K4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PTPDC1A2A3K4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PTPDC1A2A3K4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PTPDC1A2A3K4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PTPDC1A2A3K4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PTPDC1A2A3K4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PTPDC1A2A3K4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PTPDC1A2A3K4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
PTPDC1A2A3K4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PTPDC1A2A3K4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PTPDC1A2A3K4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PTPDC1A2A3K4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PTPDC1A2A3K4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
PTPDC1A2A3K4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PTPDC1A2A3K4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PTPDC1A2A3K4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PTPDC1A2A3K4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PTPDC1A2A3K4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PTPDC1A2A3K4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PTPDC1A2A3K4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PTPDC1A2A3K4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PTPDC1A2A3K4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PTPDC1A2A3K4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PTPDC1A2A3K4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
PTPDC1A2A3K4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PTPDC1A2A3K4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PTPDC1A2A3K4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PTPDC1A2A3K4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PTPDC1A2A3K4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PTPDC1A2A3K4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PTPDC1A2A3K4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PTPDC1A2A3K4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
PTPDC1A2A3K4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PTPDC1A2A3K4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PTPDC1A2A3K4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
PTPDC1A2A3K4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
PTPDC1A2A3K4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
PTPDC1A2A3K4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PTPDC1A2A3K4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PTPDC1A2A3K4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PTPDC1A2A3K4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
PTPDC1A2A3K4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PTPDC1A2A3K4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PTPDC1A2A3K4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PTPDC1A2A3K4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PTPDC1A2A3K4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PTPDC1A2A3K4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PTPDC1A2A3K4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PTPDC1A2A3K4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PTPDC1A2A3K4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PTPDC1A2A3K4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PTPDC1A2A3K4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PTPDC1A2A3K4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PTPDC1A2A3K4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PTPDC1A2A3K4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PTPDC1A2A3K4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
PTPDC1A2A3K4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
PTPDC1A2A3K4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PTPDC1A2A3K4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PTPDC1A2A3K4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PTPDC1A2A3K4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
PTPDC1A2A3K4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PTPDC1A2A3K4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTPDC1A2A3K4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTPDC1A2A3K4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTPDC1A2A3K4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTPDC1A2A3K4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PTPDC1A2A3K4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PTPDC1A2A3K4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PTPDC1A2A3K4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PTPDC1A2A3K4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PTPDC1A2A3K4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PTPDC1A2A3K4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PTPDC1A2A3K4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PTPDC1A2A3K4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PTPDC1A2A3K4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PTPDC1A2A3K4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PTPDC1A2A3K4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
PTPDC1A2A3K4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
PTPDC1A2A3K4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PTPDC1A2A3K4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PTPDC1A2A3K4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC30■■■□□ 2.39
PTPDC1A2A3K4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PTPDC1A2A3K4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PTPDC1A2A3K4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PTPDC1A2A3K4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PTPDC1A2A3K4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PTPDC1A2A3K4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PTPDC1A2A3K4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PTPDC1A2A3K4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PTPDC1A2A3K4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PTPDC1A2A3K4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PTPDC1A2A3K4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PTPDC1A2A3K4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PTPDC1A2A3K4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms