Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 TAF6-213ENST00000472509 2551 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 PAN2-203ENST00000440411 4576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 LYSMD3-203ENST00000500869 3863 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 AC079753.1-201ENST00000623243 3868 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF268-201ENST00000228289 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 AP005212.5-201ENST00000577614 3505 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 ANAPC16-201ENST00000299381 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 ADAM1A-201ENST00000424240 2129 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM110B-201ENST00000361488 3438 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 TENM3-204ENST00000511685 10896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 ANTXR2-203ENST00000403729 8273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 CABIN1-204ENST00000405822 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 ECD-201ENST00000372979 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 KRBA1-201ENST00000319551 4020 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 SPATA6-203ENST00000371847 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF44-203ENST00000356109 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 HK2P1-201ENST00000447818 2737 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 MAPK10-272ENST00000641110 2724 ntAPPRIS P2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 ANKRD50-201ENST00000504087 8794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 NAALADL1-201ENST00000340252 2376 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 GPR155-201ENST00000295500 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 TARID-205ENST00000607033 2960 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 POLDIP3-209ENST00000617178 2006 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 SMAD9-203ENST00000399275 5389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 FRMD7-202ENST00000370879 2864 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 TMEM169-205ENST00000454545 3460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 MTPN-201ENST00000393085 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 TEX11-204ENST00000395889 3133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 DHX37-201ENST00000308736 4550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 PCDHGB1-201ENST00000523390 4590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 RBM15-203ENST00000602849 3368 ntAPPRIS P1 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 CABIN1-203ENST00000398319 7480 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 RAB43-203ENST00000393305 4215 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 AC012508.1-201ENST00000564121 4476 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 TSGA10-201ENST00000355053 3037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 PTBP2-203ENST00000426398 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 KIAA0586-203ENST00000423743 5339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 ASXL2-202ENST00000404843 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC02210-CRHR1-202ENST00000634540 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 KIR3DL1-201ENST00000326542 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 GPR37L1-201ENST00000367282 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 ACSF3-218ENST00000614302 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 SIPA1L2-202ENST00000308942 2937 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 BAG5-203ENST00000445922 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 AC135012.3-201ENST00000599841 4039 ntTSL 4 BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 EPSTI1-202ENST00000313640 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 PCDH15-211ENST00000395440 3177 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 QRICH2-201ENST00000262765 5357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 OGFR-202ENST00000370461 4506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 GUCY2D-201ENST00000254854 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 TRIM32-201ENST00000373983 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 MYO7A-202ENST00000409709 7462 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 OPRK1-201ENST00000265572 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 SMG9-201ENST00000270066 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 GRIA4-201ENST00000282499 5508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 SMCR5-201ENST00000543475 2844 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 RRM1-201ENST00000300738 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF879-201ENST00000444149 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 CAMK2G-204ENST00000351293 3563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 PLK4-201ENST00000270861 3841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 TOPORS-201ENST00000360538 4098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 DRC1-201ENST00000288710 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.8 ms