Protein–RNA interactions for Protein: U3KQE9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQE9 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
U3KQE9 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
U3KQE9 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
U3KQE9 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
U3KQE9 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
U3KQE9 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
U3KQE9 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
U3KQE9 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
U3KQE9 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
U3KQE9 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
U3KQE9 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
U3KQE9 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
U3KQE9 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
U3KQE9 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
U3KQE9 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
U3KQE9 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
U3KQE9 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
U3KQE9 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
U3KQE9 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
U3KQE9 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
U3KQE9 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
U3KQE9 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
U3KQE9 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
U3KQE9 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
U3KQE9 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
U3KQE9 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
U3KQE9 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
U3KQE9 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
U3KQE9 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
U3KQE9 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
U3KQE9 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
U3KQE9 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
U3KQE9 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
U3KQE9 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
U3KQE9 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
U3KQE9 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
U3KQE9 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
U3KQE9 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
U3KQE9 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
U3KQE9 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
U3KQE9 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
U3KQE9 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
U3KQE9 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
U3KQE9 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
U3KQE9 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
U3KQE9 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
U3KQE9 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
U3KQE9 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
U3KQE9 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
U3KQE9 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
U3KQE9 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
U3KQE9 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
U3KQE9 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
U3KQE9 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
U3KQE9 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
U3KQE9 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
U3KQE9 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
U3KQE9 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
U3KQE9 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
U3KQE9 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
U3KQE9 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
U3KQE9 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
U3KQE9 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
U3KQE9 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
U3KQE9 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
U3KQE9 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
U3KQE9 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
U3KQE9 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
U3KQE9 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
U3KQE9 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
U3KQE9 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
U3KQE9 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
U3KQE9 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
U3KQE9 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
U3KQE9 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
U3KQE9 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
U3KQE9 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
U3KQE9 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
U3KQE9 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
U3KQE9 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
U3KQE9 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
U3KQE9 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
U3KQE9 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
U3KQE9 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
U3KQE9 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
U3KQE9 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
U3KQE9 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
U3KQE9 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
U3KQE9 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
U3KQE9 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
U3KQE9 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
U3KQE9 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
U3KQE9 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
U3KQE9 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
U3KQE9 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
U3KQE9 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
U3KQE9 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
U3KQE9 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
U3KQE9 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
U3KQE9 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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