Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5M8

SRPRB, Signal recognition particle receptor subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRBQ9Y5M8 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRPRBQ9Y5M8 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRPRBQ9Y5M8 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRPRBQ9Y5M8 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRPRBQ9Y5M8 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRPRBQ9Y5M8 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRPRBQ9Y5M8 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRPRBQ9Y5M8 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SRPRBQ9Y5M8 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRPRBQ9Y5M8 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SRPRBQ9Y5M8 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRPRBQ9Y5M8 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRPRBQ9Y5M8 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRPRBQ9Y5M8 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRPRBQ9Y5M8 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRPRBQ9Y5M8 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRPRBQ9Y5M8 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRPRBQ9Y5M8 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRPRBQ9Y5M8 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRPRBQ9Y5M8 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRPRBQ9Y5M8 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRPRBQ9Y5M8 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRPRBQ9Y5M8 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRPRBQ9Y5M8 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SRPRBQ9Y5M8 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRPRBQ9Y5M8 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SRPRBQ9Y5M8 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms