Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQL6

HDAC5, Histone deacetylase 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC5Q9UQL6 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HDAC5Q9UQL6 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HDAC5Q9UQL6 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HDAC5Q9UQL6 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HDAC5Q9UQL6 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDAC5Q9UQL6 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDAC5Q9UQL6 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDAC5Q9UQL6 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDAC5Q9UQL6 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDAC5Q9UQL6 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDAC5Q9UQL6 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDAC5Q9UQL6 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDAC5Q9UQL6 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDAC5Q9UQL6 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDAC5Q9UQL6 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDAC5Q9UQL6 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDAC5Q9UQL6 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDAC5Q9UQL6 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDAC5Q9UQL6 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDAC5Q9UQL6 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDAC5Q9UQL6 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
HDAC5Q9UQL6 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDAC5Q9UQL6 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDAC5Q9UQL6 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDAC5Q9UQL6 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDAC5Q9UQL6 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDAC5Q9UQL6 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HDAC5Q9UQL6 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HDAC5Q9UQL6 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HDAC5Q9UQL6 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HDAC5Q9UQL6 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HDAC5Q9UQL6 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HDAC5Q9UQL6 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HDAC5Q9UQL6 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HDAC5Q9UQL6 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HDAC5Q9UQL6 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HDAC5Q9UQL6 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HDAC5Q9UQL6 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
HDAC5Q9UQL6 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
HDAC5Q9UQL6 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HDAC5Q9UQL6 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HDAC5Q9UQL6 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HDAC5Q9UQL6 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HDAC5Q9UQL6 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HDAC5Q9UQL6 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HDAC5Q9UQL6 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HDAC5Q9UQL6 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDAC5Q9UQL6 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDAC5Q9UQL6 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDAC5Q9UQL6 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDAC5Q9UQL6 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDAC5Q9UQL6 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDAC5Q9UQL6 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDAC5Q9UQL6 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDAC5Q9UQL6 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
HDAC5Q9UQL6 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDAC5Q9UQL6 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDAC5Q9UQL6 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDAC5Q9UQL6 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDAC5Q9UQL6 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDAC5Q9UQL6 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDAC5Q9UQL6 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDAC5Q9UQL6 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDAC5Q9UQL6 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDAC5Q9UQL6 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDAC5Q9UQL6 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HDAC5Q9UQL6 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HDAC5Q9UQL6 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HDAC5Q9UQL6 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HDAC5Q9UQL6 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HDAC5Q9UQL6 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HDAC5Q9UQL6 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HDAC5Q9UQL6 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HDAC5Q9UQL6 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
HDAC5Q9UQL6 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HDAC5Q9UQL6 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HDAC5Q9UQL6 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HDAC5Q9UQL6 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HDAC5Q9UQL6 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HDAC5Q9UQL6 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HDAC5Q9UQL6 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HDAC5Q9UQL6 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HDAC5Q9UQL6 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HDAC5Q9UQL6 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HDAC5Q9UQL6 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HDAC5Q9UQL6 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HDAC5Q9UQL6 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HDAC5Q9UQL6 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HDAC5Q9UQL6 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HDAC5Q9UQL6 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HDAC5Q9UQL6 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HDAC5Q9UQL6 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HDAC5Q9UQL6 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HDAC5Q9UQL6 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HDAC5Q9UQL6 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HDAC5Q9UQL6 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HDAC5Q9UQL6 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HDAC5Q9UQL6 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HDAC5Q9UQL6 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDAC5Q9UQL6 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms