Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SHOC2Q9UQ13 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
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