Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL01

DSE, Dermatan-sulfate epimerase, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSEQ9UL01 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DSEQ9UL01 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DSEQ9UL01 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DSEQ9UL01 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DSEQ9UL01 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DSEQ9UL01 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DSEQ9UL01 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DSEQ9UL01 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DSEQ9UL01 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DSEQ9UL01 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DSEQ9UL01 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DSEQ9UL01 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DSEQ9UL01 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DSEQ9UL01 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
DSEQ9UL01 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
DSEQ9UL01 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DSEQ9UL01 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DSEQ9UL01 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DSEQ9UL01 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DSEQ9UL01 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
DSEQ9UL01 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DSEQ9UL01 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DSEQ9UL01 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DSEQ9UL01 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DSEQ9UL01 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DSEQ9UL01 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
DSEQ9UL01 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DSEQ9UL01 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
DSEQ9UL01 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
DSEQ9UL01 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DSEQ9UL01 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DSEQ9UL01 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DSEQ9UL01 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DSEQ9UL01 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DSEQ9UL01 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DSEQ9UL01 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DSEQ9UL01 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DSEQ9UL01 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DSEQ9UL01 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DSEQ9UL01 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DSEQ9UL01 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DSEQ9UL01 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DSEQ9UL01 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DSEQ9UL01 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
DSEQ9UL01 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DSEQ9UL01 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DSEQ9UL01 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DSEQ9UL01 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DSEQ9UL01 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DSEQ9UL01 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DSEQ9UL01 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DSEQ9UL01 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DSEQ9UL01 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DSEQ9UL01 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DSEQ9UL01 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DSEQ9UL01 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DSEQ9UL01 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DSEQ9UL01 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DSEQ9UL01 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DSEQ9UL01 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DSEQ9UL01 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DSEQ9UL01 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DSEQ9UL01 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DSEQ9UL01 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DSEQ9UL01 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DSEQ9UL01 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DSEQ9UL01 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DSEQ9UL01 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DSEQ9UL01 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
DSEQ9UL01 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DSEQ9UL01 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DSEQ9UL01 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DSEQ9UL01 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
DSEQ9UL01 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DSEQ9UL01 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DSEQ9UL01 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DSEQ9UL01 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
DSEQ9UL01 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DSEQ9UL01 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
DSEQ9UL01 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DSEQ9UL01 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
DSEQ9UL01 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DSEQ9UL01 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
DSEQ9UL01 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DSEQ9UL01 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DSEQ9UL01 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
DSEQ9UL01 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DSEQ9UL01 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
DSEQ9UL01 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DSEQ9UL01 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DSEQ9UL01 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
DSEQ9UL01 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
DSEQ9UL01 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DSEQ9UL01 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DSEQ9UL01 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
DSEQ9UL01 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
DSEQ9UL01 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DSEQ9UL01 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
DSEQ9UL01 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
DSEQ9UL01 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms