Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV5

AMFR, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMFRQ9UKV5 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
AMFRQ9UKV5 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
AMFRQ9UKV5 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
AMFRQ9UKV5 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
AMFRQ9UKV5 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
AMFRQ9UKV5 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
AMFRQ9UKV5 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
AMFRQ9UKV5 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
AMFRQ9UKV5 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
AMFRQ9UKV5 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
AMFRQ9UKV5 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
AMFRQ9UKV5 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
AMFRQ9UKV5 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
AMFRQ9UKV5 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
AMFRQ9UKV5 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
AMFRQ9UKV5 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
AMFRQ9UKV5 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
AMFRQ9UKV5 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
AMFRQ9UKV5 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
AMFRQ9UKV5 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
AMFRQ9UKV5 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
AMFRQ9UKV5 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
AMFRQ9UKV5 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
AMFRQ9UKV5 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
AMFRQ9UKV5 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
AMFRQ9UKV5 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
AMFRQ9UKV5 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
AMFRQ9UKV5 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
AMFRQ9UKV5 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
AMFRQ9UKV5 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
AMFRQ9UKV5 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
AMFRQ9UKV5 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
AMFRQ9UKV5 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
AMFRQ9UKV5 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
AMFRQ9UKV5 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
AMFRQ9UKV5 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
AMFRQ9UKV5 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
AMFRQ9UKV5 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
AMFRQ9UKV5 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
AMFRQ9UKV5 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
AMFRQ9UKV5 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
AMFRQ9UKV5 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
AMFRQ9UKV5 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
AMFRQ9UKV5 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
AMFRQ9UKV5 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
AMFRQ9UKV5 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
AMFRQ9UKV5 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
AMFRQ9UKV5 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
AMFRQ9UKV5 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
AMFRQ9UKV5 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
AMFRQ9UKV5 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
AMFRQ9UKV5 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
AMFRQ9UKV5 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
AMFRQ9UKV5 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
AMFRQ9UKV5 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
AMFRQ9UKV5 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
AMFRQ9UKV5 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
AMFRQ9UKV5 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
AMFRQ9UKV5 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
AMFRQ9UKV5 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
AMFRQ9UKV5 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
AMFRQ9UKV5 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
AMFRQ9UKV5 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
AMFRQ9UKV5 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
AMFRQ9UKV5 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
AMFRQ9UKV5 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
AMFRQ9UKV5 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
AMFRQ9UKV5 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
AMFRQ9UKV5 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
AMFRQ9UKV5 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
AMFRQ9UKV5 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
AMFRQ9UKV5 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
AMFRQ9UKV5 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
AMFRQ9UKV5 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
AMFRQ9UKV5 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
AMFRQ9UKV5 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
AMFRQ9UKV5 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
AMFRQ9UKV5 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
AMFRQ9UKV5 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
AMFRQ9UKV5 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
AMFRQ9UKV5 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
AMFRQ9UKV5 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
AMFRQ9UKV5 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
AMFRQ9UKV5 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
AMFRQ9UKV5 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
AMFRQ9UKV5 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
AMFRQ9UKV5 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
AMFRQ9UKV5 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
AMFRQ9UKV5 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
AMFRQ9UKV5 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
AMFRQ9UKV5 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
AMFRQ9UKV5 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
AMFRQ9UKV5 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
AMFRQ9UKV5 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
AMFRQ9UKV5 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
AMFRQ9UKV5 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
AMFRQ9UKV5 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
AMFRQ9UKV5 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
AMFRQ9UKV5 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
AMFRQ9UKV5 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms