Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PACSIN3Q9UKS6 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PACSIN3Q9UKS6 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms