Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RABGEF1Q9UJ41 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
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RABGEF1Q9UJ41 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RABGEF1Q9UJ41 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RABGEF1Q9UJ41 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RABGEF1Q9UJ41 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RABGEF1Q9UJ41 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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RABGEF1Q9UJ41 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RABGEF1Q9UJ41 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RABGEF1Q9UJ41 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RABGEF1Q9UJ41 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RABGEF1Q9UJ41 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RABGEF1Q9UJ41 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RABGEF1Q9UJ41 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RABGEF1Q9UJ41 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RABGEF1Q9UJ41 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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RABGEF1Q9UJ41 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
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RABGEF1Q9UJ41 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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RABGEF1Q9UJ41 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
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RABGEF1Q9UJ41 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RABGEF1Q9UJ41 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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RABGEF1Q9UJ41 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RABGEF1Q9UJ41 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RABGEF1Q9UJ41 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RABGEF1Q9UJ41 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RABGEF1Q9UJ41 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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RABGEF1Q9UJ41 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RABGEF1Q9UJ41 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
RABGEF1Q9UJ41 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RABGEF1Q9UJ41 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RABGEF1Q9UJ41 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RABGEF1Q9UJ41 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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