Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIA0

CYTH4, Cytohesin-4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH4Q9UIA0 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CYTH4Q9UIA0 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CYTH4Q9UIA0 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYTH4Q9UIA0 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYTH4Q9UIA0 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYTH4Q9UIA0 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYTH4Q9UIA0 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYTH4Q9UIA0 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYTH4Q9UIA0 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYTH4Q9UIA0 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYTH4Q9UIA0 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYTH4Q9UIA0 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYTH4Q9UIA0 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYTH4Q9UIA0 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYTH4Q9UIA0 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYTH4Q9UIA0 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYTH4Q9UIA0 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CYTH4Q9UIA0 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYTH4Q9UIA0 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYTH4Q9UIA0 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYTH4Q9UIA0 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYTH4Q9UIA0 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CYTH4Q9UIA0 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CYTH4Q9UIA0 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CYTH4Q9UIA0 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CYTH4Q9UIA0 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CYTH4Q9UIA0 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CYTH4Q9UIA0 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CYTH4Q9UIA0 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CYTH4Q9UIA0 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CYTH4Q9UIA0 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CYTH4Q9UIA0 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CYTH4Q9UIA0 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CYTH4Q9UIA0 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CYTH4Q9UIA0 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CYTH4Q9UIA0 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CYTH4Q9UIA0 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CYTH4Q9UIA0 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CYTH4Q9UIA0 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CYTH4Q9UIA0 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CYTH4Q9UIA0 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CYTH4Q9UIA0 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CYTH4Q9UIA0 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CYTH4Q9UIA0 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CYTH4Q9UIA0 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CYTH4Q9UIA0 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CYTH4Q9UIA0 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CYTH4Q9UIA0 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CYTH4Q9UIA0 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CYTH4Q9UIA0 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CYTH4Q9UIA0 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CYTH4Q9UIA0 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CYTH4Q9UIA0 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CYTH4Q9UIA0 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CYTH4Q9UIA0 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CYTH4Q9UIA0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CYTH4Q9UIA0 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CYTH4Q9UIA0 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CYTH4Q9UIA0 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CYTH4Q9UIA0 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CYTH4Q9UIA0 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CYTH4Q9UIA0 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CYTH4Q9UIA0 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CYTH4Q9UIA0 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CYTH4Q9UIA0 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CYTH4Q9UIA0 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CYTH4Q9UIA0 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CYTH4Q9UIA0 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CYTH4Q9UIA0 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CYTH4Q9UIA0 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CYTH4Q9UIA0 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CYTH4Q9UIA0 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CYTH4Q9UIA0 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CYTH4Q9UIA0 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CYTH4Q9UIA0 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CYTH4Q9UIA0 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CYTH4Q9UIA0 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CYTH4Q9UIA0 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CYTH4Q9UIA0 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CYTH4Q9UIA0 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CYTH4Q9UIA0 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CYTH4Q9UIA0 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CYTH4Q9UIA0 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CYTH4Q9UIA0 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CYTH4Q9UIA0 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CYTH4Q9UIA0 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CYTH4Q9UIA0 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CYTH4Q9UIA0 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CYTH4Q9UIA0 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CYTH4Q9UIA0 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CYTH4Q9UIA0 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CYTH4Q9UIA0 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CYTH4Q9UIA0 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CYTH4Q9UIA0 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CYTH4Q9UIA0 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CYTH4Q9UIA0 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CYTH4Q9UIA0 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CYTH4Q9UIA0 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CYTH4Q9UIA0 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CYTH4Q9UIA0 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms