Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHX1

PUF60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60Q9UHX1 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PUF60Q9UHX1 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PUF60Q9UHX1 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PUF60Q9UHX1 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PUF60Q9UHX1 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PUF60Q9UHX1 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PUF60Q9UHX1 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PUF60Q9UHX1 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PUF60Q9UHX1 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PUF60Q9UHX1 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PUF60Q9UHX1 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PUF60Q9UHX1 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PUF60Q9UHX1 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PUF60Q9UHX1 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PUF60Q9UHX1 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PUF60Q9UHX1 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PUF60Q9UHX1 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PUF60Q9UHX1 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PUF60Q9UHX1 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PUF60Q9UHX1 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PUF60Q9UHX1 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PUF60Q9UHX1 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PUF60Q9UHX1 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PUF60Q9UHX1 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PUF60Q9UHX1 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PUF60Q9UHX1 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PUF60Q9UHX1 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PUF60Q9UHX1 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PUF60Q9UHX1 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PUF60Q9UHX1 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PUF60Q9UHX1 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PUF60Q9UHX1 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PUF60Q9UHX1 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PUF60Q9UHX1 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PUF60Q9UHX1 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PUF60Q9UHX1 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PUF60Q9UHX1 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
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