Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL42Q9P2K6 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL42Q9P2K6 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL42Q9P2K6 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL42Q9P2K6 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL42Q9P2K6 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL42Q9P2K6 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL42Q9P2K6 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL42Q9P2K6 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL42Q9P2K6 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL42Q9P2K6 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL42Q9P2K6 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL42Q9P2K6 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL42Q9P2K6 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL42Q9P2K6 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL42Q9P2K6 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL42Q9P2K6 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL42Q9P2K6 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL42Q9P2K6 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL42Q9P2K6 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL42Q9P2K6 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL42Q9P2K6 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL42Q9P2K6 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL42Q9P2K6 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL42Q9P2K6 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL42Q9P2K6 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL42Q9P2K6 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL42Q9P2K6 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL42Q9P2K6 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL42Q9P2K6 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL42Q9P2K6 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL42Q9P2K6 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL42Q9P2K6 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL42Q9P2K6 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL42Q9P2K6 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL42Q9P2K6 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL42Q9P2K6 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL42Q9P2K6 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL42Q9P2K6 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL42Q9P2K6 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL42Q9P2K6 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL42Q9P2K6 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL42Q9P2K6 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL42Q9P2K6 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL42Q9P2K6 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL42Q9P2K6 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL42Q9P2K6 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL42Q9P2K6 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL42Q9P2K6 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL42Q9P2K6 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL42Q9P2K6 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL42Q9P2K6 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL42Q9P2K6 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL42Q9P2K6 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL42Q9P2K6 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL42Q9P2K6 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL42Q9P2K6 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL42Q9P2K6 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL42Q9P2K6 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL42Q9P2K6 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL42Q9P2K6 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL42Q9P2K6 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL42Q9P2K6 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL42Q9P2K6 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL42Q9P2K6 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL42Q9P2K6 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL42Q9P2K6 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL42Q9P2K6 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL42Q9P2K6 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
KLHL42Q9P2K6 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
KLHL42Q9P2K6 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KLHL42Q9P2K6 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
KLHL42Q9P2K6 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
KLHL42Q9P2K6 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL42Q9P2K6 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms