Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HCN3Q9P1Z3 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms