Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN5

ARHGEF12, Rho guanine nucleotide exchange factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF12Q9NZN5 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ARHGEF12Q9NZN5 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ARHGEF12Q9NZN5 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ARHGEF12Q9NZN5 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ARHGEF12Q9NZN5 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ARHGEF12Q9NZN5 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ARHGEF12Q9NZN5 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
ARHGEF12Q9NZN5 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ARHGEF12Q9NZN5 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ARHGEF12Q9NZN5 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ARHGEF12Q9NZN5 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ARHGEF12Q9NZN5 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
ARHGEF12Q9NZN5 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ARHGEF12Q9NZN5 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ARHGEF12Q9NZN5 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
ARHGEF12Q9NZN5 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ARHGEF12Q9NZN5 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ARHGEF12Q9NZN5 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ARHGEF12Q9NZN5 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ARHGEF12Q9NZN5 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ARHGEF12Q9NZN5 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ARHGEF12Q9NZN5 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ARHGEF12Q9NZN5 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ARHGEF12Q9NZN5 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ARHGEF12Q9NZN5 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ARHGEF12Q9NZN5 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
ARHGEF12Q9NZN5 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ARHGEF12Q9NZN5 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ARHGEF12Q9NZN5 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ARHGEF12Q9NZN5 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
ARHGEF12Q9NZN5 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ARHGEF12Q9NZN5 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ARHGEF12Q9NZN5 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ARHGEF12Q9NZN5 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ARHGEF12Q9NZN5 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ARHGEF12Q9NZN5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ARHGEF12Q9NZN5 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ARHGEF12Q9NZN5 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ARHGEF12Q9NZN5 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ARHGEF12Q9NZN5 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ARHGEF12Q9NZN5 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ARHGEF12Q9NZN5 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
ARHGEF12Q9NZN5 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
ARHGEF12Q9NZN5 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC29.51■■■□□ 2.32
ARHGEF12Q9NZN5 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
ARHGEF12Q9NZN5 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
ARHGEF12Q9NZN5 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC29.51■■■□□ 2.32
ARHGEF12Q9NZN5 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
ARHGEF12Q9NZN5 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
ARHGEF12Q9NZN5 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ARHGEF12Q9NZN5 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ARHGEF12Q9NZN5 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ARHGEF12Q9NZN5 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ARHGEF12Q9NZN5 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ARHGEF12Q9NZN5 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
ARHGEF12Q9NZN5 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ARHGEF12Q9NZN5 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ARHGEF12Q9NZN5 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ARHGEF12Q9NZN5 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ARHGEF12Q9NZN5 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ARHGEF12Q9NZN5 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ARHGEF12Q9NZN5 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
ARHGEF12Q9NZN5 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ARHGEF12Q9NZN5 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ARHGEF12Q9NZN5 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ARHGEF12Q9NZN5 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ARHGEF12Q9NZN5 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ARHGEF12Q9NZN5 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ARHGEF12Q9NZN5 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ARHGEF12Q9NZN5 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ARHGEF12Q9NZN5 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ARHGEF12Q9NZN5 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ARHGEF12Q9NZN5 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ARHGEF12Q9NZN5 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ARHGEF12Q9NZN5 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ARHGEF12Q9NZN5 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ARHGEF12Q9NZN5 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ARHGEF12Q9NZN5 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ARHGEF12Q9NZN5 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ARHGEF12Q9NZN5 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ARHGEF12Q9NZN5 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ARHGEF12Q9NZN5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ARHGEF12Q9NZN5 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ARHGEF12Q9NZN5 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ARHGEF12Q9NZN5 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ARHGEF12Q9NZN5 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
ARHGEF12Q9NZN5 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ARHGEF12Q9NZN5 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ARHGEF12Q9NZN5 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ARHGEF12Q9NZN5 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ARHGEF12Q9NZN5 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ARHGEF12Q9NZN5 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ARHGEF12Q9NZN5 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ARHGEF12Q9NZN5 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ARHGEF12Q9NZN5 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ARHGEF12Q9NZN5 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ARHGEF12Q9NZN5 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ARHGEF12Q9NZN5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ARHGEF12Q9NZN5 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ARHGEF12Q9NZN5 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms