Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH9

TRMT1, tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT1Q9NXH9 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRMT1Q9NXH9 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRMT1Q9NXH9 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRMT1Q9NXH9 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRMT1Q9NXH9 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRMT1Q9NXH9 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRMT1Q9NXH9 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRMT1Q9NXH9 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRMT1Q9NXH9 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TRMT1Q9NXH9 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRMT1Q9NXH9 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRMT1Q9NXH9 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRMT1Q9NXH9 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRMT1Q9NXH9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRMT1Q9NXH9 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TRMT1Q9NXH9 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRMT1Q9NXH9 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRMT1Q9NXH9 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TRMT1Q9NXH9 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TRMT1Q9NXH9 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRMT1Q9NXH9 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRMT1Q9NXH9 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRMT1Q9NXH9 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRMT1Q9NXH9 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRMT1Q9NXH9 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRMT1Q9NXH9 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRMT1Q9NXH9 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRMT1Q9NXH9 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRMT1Q9NXH9 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRMT1Q9NXH9 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRMT1Q9NXH9 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TRMT1Q9NXH9 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRMT1Q9NXH9 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRMT1Q9NXH9 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRMT1Q9NXH9 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRMT1Q9NXH9 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRMT1Q9NXH9 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRMT1Q9NXH9 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TRMT1Q9NXH9 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TRMT1Q9NXH9 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TRMT1Q9NXH9 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRMT1Q9NXH9 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRMT1Q9NXH9 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRMT1Q9NXH9 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRMT1Q9NXH9 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRMT1Q9NXH9 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRMT1Q9NXH9 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRMT1Q9NXH9 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRMT1Q9NXH9 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRMT1Q9NXH9 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRMT1Q9NXH9 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRMT1Q9NXH9 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRMT1Q9NXH9 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRMT1Q9NXH9 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRMT1Q9NXH9 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRMT1Q9NXH9 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRMT1Q9NXH9 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRMT1Q9NXH9 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRMT1Q9NXH9 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRMT1Q9NXH9 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRMT1Q9NXH9 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRMT1Q9NXH9 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TRMT1Q9NXH9 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRMT1Q9NXH9 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRMT1Q9NXH9 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRMT1Q9NXH9 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRMT1Q9NXH9 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRMT1Q9NXH9 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRMT1Q9NXH9 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRMT1Q9NXH9 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRMT1Q9NXH9 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRMT1Q9NXH9 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRMT1Q9NXH9 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRMT1Q9NXH9 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRMT1Q9NXH9 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRMT1Q9NXH9 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRMT1Q9NXH9 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRMT1Q9NXH9 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRMT1Q9NXH9 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TRMT1Q9NXH9 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRMT1Q9NXH9 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRMT1Q9NXH9 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TRMT1Q9NXH9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRMT1Q9NXH9 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRMT1Q9NXH9 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRMT1Q9NXH9 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRMT1Q9NXH9 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRMT1Q9NXH9 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRMT1Q9NXH9 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRMT1Q9NXH9 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRMT1Q9NXH9 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRMT1Q9NXH9 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRMT1Q9NXH9 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRMT1Q9NXH9 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TRMT1Q9NXH9 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRMT1Q9NXH9 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRMT1Q9NXH9 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRMT1Q9NXH9 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRMT1Q9NXH9 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRMT1Q9NXH9 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms