Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX00

TMEM160, Transmembrane protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM160Q9NX00 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM160Q9NX00 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM160Q9NX00 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM160Q9NX00 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM160Q9NX00 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM160Q9NX00 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM160Q9NX00 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM160Q9NX00 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM160Q9NX00 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM160Q9NX00 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM160Q9NX00 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM160Q9NX00 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM160Q9NX00 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM160Q9NX00 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM160Q9NX00 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM160Q9NX00 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM160Q9NX00 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM160Q9NX00 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM160Q9NX00 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM160Q9NX00 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM160Q9NX00 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM160Q9NX00 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM160Q9NX00 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM160Q9NX00 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM160Q9NX00 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM160Q9NX00 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM160Q9NX00 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM160Q9NX00 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM160Q9NX00 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM160Q9NX00 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM160Q9NX00 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM160Q9NX00 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM160Q9NX00 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM160Q9NX00 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM160Q9NX00 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM160Q9NX00 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM160Q9NX00 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM160Q9NX00 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM160Q9NX00 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM160Q9NX00 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM160Q9NX00 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM160Q9NX00 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM160Q9NX00 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM160Q9NX00 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM160Q9NX00 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM160Q9NX00 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM160Q9NX00 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM160Q9NX00 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM160Q9NX00 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM160Q9NX00 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM160Q9NX00 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM160Q9NX00 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM160Q9NX00 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM160Q9NX00 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM160Q9NX00 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM160Q9NX00 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM160Q9NX00 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM160Q9NX00 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM160Q9NX00 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM160Q9NX00 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM160Q9NX00 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM160Q9NX00 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM160Q9NX00 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM160Q9NX00 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM160Q9NX00 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM160Q9NX00 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM160Q9NX00 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM160Q9NX00 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM160Q9NX00 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM160Q9NX00 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM160Q9NX00 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM160Q9NX00 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM160Q9NX00 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM160Q9NX00 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM160Q9NX00 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM160Q9NX00 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM160Q9NX00 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM160Q9NX00 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM160Q9NX00 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM160Q9NX00 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM160Q9NX00 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM160Q9NX00 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM160Q9NX00 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM160Q9NX00 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM160Q9NX00 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM160Q9NX00 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM160Q9NX00 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM160Q9NX00 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM160Q9NX00 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM160Q9NX00 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM160Q9NX00 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM160Q9NX00 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM160Q9NX00 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM160Q9NX00 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM160Q9NX00 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM160Q9NX00 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM160Q9NX00 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TMEM160Q9NX00 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM160Q9NX00 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM160Q9NX00 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms