Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTQ9

GJB4, Gap junction beta-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB4Q9NTQ9 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJB4Q9NTQ9 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJB4Q9NTQ9 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJB4Q9NTQ9 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJB4Q9NTQ9 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJB4Q9NTQ9 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJB4Q9NTQ9 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJB4Q9NTQ9 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJB4Q9NTQ9 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJB4Q9NTQ9 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJB4Q9NTQ9 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJB4Q9NTQ9 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJB4Q9NTQ9 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJB4Q9NTQ9 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GJB4Q9NTQ9 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJB4Q9NTQ9 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJB4Q9NTQ9 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJB4Q9NTQ9 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJB4Q9NTQ9 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJB4Q9NTQ9 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJB4Q9NTQ9 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJB4Q9NTQ9 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJB4Q9NTQ9 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJB4Q9NTQ9 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJB4Q9NTQ9 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJB4Q9NTQ9 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJB4Q9NTQ9 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJB4Q9NTQ9 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJB4Q9NTQ9 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJB4Q9NTQ9 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJB4Q9NTQ9 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJB4Q9NTQ9 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJB4Q9NTQ9 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJB4Q9NTQ9 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJB4Q9NTQ9 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJB4Q9NTQ9 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJB4Q9NTQ9 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GJB4Q9NTQ9 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJB4Q9NTQ9 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJB4Q9NTQ9 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJB4Q9NTQ9 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJB4Q9NTQ9 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJB4Q9NTQ9 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJB4Q9NTQ9 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJB4Q9NTQ9 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJB4Q9NTQ9 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJB4Q9NTQ9 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJB4Q9NTQ9 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJB4Q9NTQ9 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJB4Q9NTQ9 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJB4Q9NTQ9 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJB4Q9NTQ9 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJB4Q9NTQ9 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJB4Q9NTQ9 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJB4Q9NTQ9 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJB4Q9NTQ9 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJB4Q9NTQ9 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJB4Q9NTQ9 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJB4Q9NTQ9 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJB4Q9NTQ9 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJB4Q9NTQ9 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJB4Q9NTQ9 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJB4Q9NTQ9 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJB4Q9NTQ9 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJB4Q9NTQ9 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJB4Q9NTQ9 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJB4Q9NTQ9 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJB4Q9NTQ9 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJB4Q9NTQ9 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJB4Q9NTQ9 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJB4Q9NTQ9 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJB4Q9NTQ9 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJB4Q9NTQ9 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJB4Q9NTQ9 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJB4Q9NTQ9 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJB4Q9NTQ9 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJB4Q9NTQ9 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJB4Q9NTQ9 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GJB4Q9NTQ9 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJB4Q9NTQ9 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GJB4Q9NTQ9 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJB4Q9NTQ9 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GJB4Q9NTQ9 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJB4Q9NTQ9 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJB4Q9NTQ9 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJB4Q9NTQ9 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJB4Q9NTQ9 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJB4Q9NTQ9 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJB4Q9NTQ9 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJB4Q9NTQ9 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJB4Q9NTQ9 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJB4Q9NTQ9 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJB4Q9NTQ9 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJB4Q9NTQ9 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJB4Q9NTQ9 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJB4Q9NTQ9 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJB4Q9NTQ9 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJB4Q9NTQ9 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJB4Q9NTQ9 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJB4Q9NTQ9 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms