Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF2

SH2B1, SH2B adapter protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2B1Q9NRF2 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SH2B1Q9NRF2 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SH2B1Q9NRF2 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH2B1Q9NRF2 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH2B1Q9NRF2 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH2B1Q9NRF2 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH2B1Q9NRF2 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH2B1Q9NRF2 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH2B1Q9NRF2 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH2B1Q9NRF2 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH2B1Q9NRF2 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH2B1Q9NRF2 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH2B1Q9NRF2 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH2B1Q9NRF2 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH2B1Q9NRF2 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH2B1Q9NRF2 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH2B1Q9NRF2 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH2B1Q9NRF2 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH2B1Q9NRF2 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH2B1Q9NRF2 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SH2B1Q9NRF2 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SH2B1Q9NRF2 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH2B1Q9NRF2 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH2B1Q9NRF2 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH2B1Q9NRF2 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH2B1Q9NRF2 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH2B1Q9NRF2 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH2B1Q9NRF2 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH2B1Q9NRF2 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SH2B1Q9NRF2 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH2B1Q9NRF2 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH2B1Q9NRF2 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH2B1Q9NRF2 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SH2B1Q9NRF2 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH2B1Q9NRF2 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH2B1Q9NRF2 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH2B1Q9NRF2 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH2B1Q9NRF2 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SH2B1Q9NRF2 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH2B1Q9NRF2 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH2B1Q9NRF2 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH2B1Q9NRF2 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH2B1Q9NRF2 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SH2B1Q9NRF2 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH2B1Q9NRF2 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH2B1Q9NRF2 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH2B1Q9NRF2 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH2B1Q9NRF2 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH2B1Q9NRF2 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH2B1Q9NRF2 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SH2B1Q9NRF2 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SH2B1Q9NRF2 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SH2B1Q9NRF2 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SH2B1Q9NRF2 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SH2B1Q9NRF2 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SH2B1Q9NRF2 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SH2B1Q9NRF2 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SH2B1Q9NRF2 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SH2B1Q9NRF2 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SH2B1Q9NRF2 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SH2B1Q9NRF2 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SH2B1Q9NRF2 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SH2B1Q9NRF2 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SH2B1Q9NRF2 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SH2B1Q9NRF2 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SH2B1Q9NRF2 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SH2B1Q9NRF2 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SH2B1Q9NRF2 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SH2B1Q9NRF2 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SH2B1Q9NRF2 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SH2B1Q9NRF2 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SH2B1Q9NRF2 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SH2B1Q9NRF2 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SH2B1Q9NRF2 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SH2B1Q9NRF2 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SH2B1Q9NRF2 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SH2B1Q9NRF2 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SH2B1Q9NRF2 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SH2B1Q9NRF2 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SH2B1Q9NRF2 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SH2B1Q9NRF2 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SH2B1Q9NRF2 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SH2B1Q9NRF2 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SH2B1Q9NRF2 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SH2B1Q9NRF2 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SH2B1Q9NRF2 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SH2B1Q9NRF2 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SH2B1Q9NRF2 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SH2B1Q9NRF2 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SH2B1Q9NRF2 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SH2B1Q9NRF2 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SH2B1Q9NRF2 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SH2B1Q9NRF2 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SH2B1Q9NRF2 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SH2B1Q9NRF2 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SH2B1Q9NRF2 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SH2B1Q9NRF2 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SH2B1Q9NRF2 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SH2B1Q9NRF2 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SH2B1Q9NRF2 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms