Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
LHX9Q9NQ69 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LHX9Q9NQ69 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LHX9Q9NQ69 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
LHX9Q9NQ69 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
LHX9Q9NQ69 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LHX9Q9NQ69 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LHX9Q9NQ69 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LHX9Q9NQ69 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LHX9Q9NQ69 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LHX9Q9NQ69 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
LHX9Q9NQ69 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LHX9Q9NQ69 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LHX9Q9NQ69 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LHX9Q9NQ69 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LHX9Q9NQ69 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LHX9Q9NQ69 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LHX9Q9NQ69 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LHX9Q9NQ69 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LHX9Q9NQ69 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LHX9Q9NQ69 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LHX9Q9NQ69 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LHX9Q9NQ69 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LHX9Q9NQ69 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LHX9Q9NQ69 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LHX9Q9NQ69 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
LHX9Q9NQ69 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LHX9Q9NQ69 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LHX9Q9NQ69 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LHX9Q9NQ69 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LHX9Q9NQ69 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LHX9Q9NQ69 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LHX9Q9NQ69 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LHX9Q9NQ69 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LHX9Q9NQ69 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LHX9Q9NQ69 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LHX9Q9NQ69 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LHX9Q9NQ69 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LHX9Q9NQ69 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LHX9Q9NQ69 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LHX9Q9NQ69 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LHX9Q9NQ69 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LHX9Q9NQ69 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LHX9Q9NQ69 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LHX9Q9NQ69 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LHX9Q9NQ69 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LHX9Q9NQ69 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LHX9Q9NQ69 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LHX9Q9NQ69 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
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LHX9Q9NQ69 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LHX9Q9NQ69 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LHX9Q9NQ69 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LHX9Q9NQ69 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LHX9Q9NQ69 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LHX9Q9NQ69 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LHX9Q9NQ69 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LHX9Q9NQ69 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
LHX9Q9NQ69 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LHX9Q9NQ69 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LHX9Q9NQ69 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LHX9Q9NQ69 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LHX9Q9NQ69 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LHX9Q9NQ69 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
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LHX9Q9NQ69 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LHX9Q9NQ69 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LHX9Q9NQ69 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LHX9Q9NQ69 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LHX9Q9NQ69 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
LHX9Q9NQ69 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LHX9Q9NQ69 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LHX9Q9NQ69 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
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LHX9Q9NQ69 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LHX9Q9NQ69 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
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LHX9Q9NQ69 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LHX9Q9NQ69 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LHX9Q9NQ69 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LHX9Q9NQ69 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LHX9Q9NQ69 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LHX9Q9NQ69 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LHX9Q9NQ69 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LHX9Q9NQ69 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LHX9Q9NQ69 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LHX9Q9NQ69 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LHX9Q9NQ69 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LHX9Q9NQ69 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LHX9Q9NQ69 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LHX9Q9NQ69 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LHX9Q9NQ69 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LHX9Q9NQ69 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LHX9Q9NQ69 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
LHX9Q9NQ69 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LHX9Q9NQ69 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LHX9Q9NQ69 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LHX9Q9NQ69 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LHX9Q9NQ69 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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