Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
A4GALTQ9NPC4 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
A4GALTQ9NPC4 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
A4GALTQ9NPC4 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
A4GALTQ9NPC4 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
A4GALTQ9NPC4 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
A4GALTQ9NPC4 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
A4GALTQ9NPC4 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
A4GALTQ9NPC4 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
A4GALTQ9NPC4 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
A4GALTQ9NPC4 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
A4GALTQ9NPC4 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
A4GALTQ9NPC4 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
A4GALTQ9NPC4 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
A4GALTQ9NPC4 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
A4GALTQ9NPC4 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
A4GALTQ9NPC4 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
A4GALTQ9NPC4 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
A4GALTQ9NPC4 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
A4GALTQ9NPC4 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
A4GALTQ9NPC4 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
A4GALTQ9NPC4 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
A4GALTQ9NPC4 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
A4GALTQ9NPC4 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
A4GALTQ9NPC4 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
A4GALTQ9NPC4 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
A4GALTQ9NPC4 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
A4GALTQ9NPC4 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
A4GALTQ9NPC4 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
A4GALTQ9NPC4 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
A4GALTQ9NPC4 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
A4GALTQ9NPC4 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
A4GALTQ9NPC4 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
A4GALTQ9NPC4 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
A4GALTQ9NPC4 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
A4GALTQ9NPC4 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms