Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBG7

LY9, T-lymphocyte surface antigen Ly-9, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY9Q9HBG7 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LY9Q9HBG7 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LY9Q9HBG7 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LY9Q9HBG7 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LY9Q9HBG7 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LY9Q9HBG7 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LY9Q9HBG7 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LY9Q9HBG7 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LY9Q9HBG7 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LY9Q9HBG7 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LY9Q9HBG7 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LY9Q9HBG7 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LY9Q9HBG7 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LY9Q9HBG7 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LY9Q9HBG7 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LY9Q9HBG7 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LY9Q9HBG7 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LY9Q9HBG7 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LY9Q9HBG7 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LY9Q9HBG7 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LY9Q9HBG7 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LY9Q9HBG7 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LY9Q9HBG7 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LY9Q9HBG7 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LY9Q9HBG7 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LY9Q9HBG7 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LY9Q9HBG7 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LY9Q9HBG7 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LY9Q9HBG7 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LY9Q9HBG7 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LY9Q9HBG7 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LY9Q9HBG7 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LY9Q9HBG7 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LY9Q9HBG7 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LY9Q9HBG7 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LY9Q9HBG7 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LY9Q9HBG7 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LY9Q9HBG7 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LY9Q9HBG7 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LY9Q9HBG7 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LY9Q9HBG7 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LY9Q9HBG7 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms