Protein–RNA interactions for Protein: Q9H875

PRKRIP1, PRKR-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKRIP1Q9H875 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRKRIP1Q9H875 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRKRIP1Q9H875 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRKRIP1Q9H875 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
PRKRIP1Q9H875 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
PRKRIP1Q9H875 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRKRIP1Q9H875 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRKRIP1Q9H875 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRKRIP1Q9H875 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRKRIP1Q9H875 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRKRIP1Q9H875 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRKRIP1Q9H875 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRKRIP1Q9H875 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRKRIP1Q9H875 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRKRIP1Q9H875 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRKRIP1Q9H875 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRKRIP1Q9H875 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRKRIP1Q9H875 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRKRIP1Q9H875 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRKRIP1Q9H875 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRKRIP1Q9H875 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRKRIP1Q9H875 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRKRIP1Q9H875 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRKRIP1Q9H875 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRKRIP1Q9H875 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRKRIP1Q9H875 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRKRIP1Q9H875 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRKRIP1Q9H875 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRKRIP1Q9H875 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRKRIP1Q9H875 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRKRIP1Q9H875 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRKRIP1Q9H875 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRKRIP1Q9H875 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PRKRIP1Q9H875 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRKRIP1Q9H875 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRKRIP1Q9H875 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRKRIP1Q9H875 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRKRIP1Q9H875 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRKRIP1Q9H875 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRKRIP1Q9H875 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRKRIP1Q9H875 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRKRIP1Q9H875 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRKRIP1Q9H875 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRKRIP1Q9H875 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRKRIP1Q9H875 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRKRIP1Q9H875 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRKRIP1Q9H875 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRKRIP1Q9H875 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRKRIP1Q9H875 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRKRIP1Q9H875 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRKRIP1Q9H875 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRKRIP1Q9H875 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRKRIP1Q9H875 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRKRIP1Q9H875 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRKRIP1Q9H875 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
PRKRIP1Q9H875 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRKRIP1Q9H875 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRKRIP1Q9H875 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
PRKRIP1Q9H875 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRKRIP1Q9H875 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRKRIP1Q9H875 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRKRIP1Q9H875 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
PRKRIP1Q9H875 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRKRIP1Q9H875 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRKRIP1Q9H875 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRKRIP1Q9H875 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
PRKRIP1Q9H875 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRKRIP1Q9H875 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRKRIP1Q9H875 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRKRIP1Q9H875 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRKRIP1Q9H875 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRKRIP1Q9H875 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRKRIP1Q9H875 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRKRIP1Q9H875 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRKRIP1Q9H875 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRKRIP1Q9H875 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRKRIP1Q9H875 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRKRIP1Q9H875 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRKRIP1Q9H875 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRKRIP1Q9H875 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PRKRIP1Q9H875 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRKRIP1Q9H875 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRKRIP1Q9H875 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRKRIP1Q9H875 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRKRIP1Q9H875 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRKRIP1Q9H875 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRKRIP1Q9H875 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRKRIP1Q9H875 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRKRIP1Q9H875 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRKRIP1Q9H875 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRKRIP1Q9H875 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PRKRIP1Q9H875 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRKRIP1Q9H875 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PRKRIP1Q9H875 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRKRIP1Q9H875 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRKRIP1Q9H875 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRKRIP1Q9H875 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRKRIP1Q9H875 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRKRIP1Q9H875 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRKRIP1Q9H875 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms