Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L4

SENP3, Sentrin-specific protease 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3Q9H4L4 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SENP3Q9H4L4 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SENP3Q9H4L4 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SENP3Q9H4L4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SENP3Q9H4L4 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SENP3Q9H4L4 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SENP3Q9H4L4 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
SENP3Q9H4L4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SENP3Q9H4L4 RABGGTB-201ENST00000319942 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SENP3Q9H4L4 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SENP3Q9H4L4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SENP3Q9H4L4 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SENP3Q9H4L4 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SENP3Q9H4L4 HIBCH-207ENST00000410045 854 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SENP3Q9H4L4 AL354956.1-201ENST00000424487 467 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SENP3Q9H4L4 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SENP3Q9H4L4 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SENP3Q9H4L4 KDELR2-206ENST00000490996 655 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SENP3Q9H4L4 PTS-202ENST00000524931 696 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SENP3Q9H4L4 PTS-204ENST00000525803 625 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SENP3Q9H4L4 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SENP3Q9H4L4 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SENP3Q9H4L4 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SENP3Q9H4L4 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SENP3Q9H4L4 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SENP3Q9H4L4 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SENP3Q9H4L4 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
SENP3Q9H4L4 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SENP3Q9H4L4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SENP3Q9H4L4 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SENP3Q9H4L4 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
SENP3Q9H4L4 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SENP3Q9H4L4 AL929472.2-201ENST00000419993 481 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SENP3Q9H4L4 AC036101.1-201ENST00000449272 597 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SENP3Q9H4L4 USP9YP2-201ENST00000504503 1000 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
SENP3Q9H4L4 USP9YP1-201ENST00000513521 1002 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
SENP3Q9H4L4 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SENP3Q9H4L4 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
SENP3Q9H4L4 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
SENP3Q9H4L4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SENP3Q9H4L4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SENP3Q9H4L4 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SENP3Q9H4L4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SENP3Q9H4L4 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SENP3Q9H4L4 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SENP3Q9H4L4 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SENP3Q9H4L4 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SENP3Q9H4L4 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SENP3Q9H4L4 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SENP3Q9H4L4 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SENP3Q9H4L4 AL645634.1-201ENST00000418426 462 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SENP3Q9H4L4 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
SENP3Q9H4L4 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SENP3Q9H4L4 RORA-AS1-201ENST00000501579 761 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SENP3Q9H4L4 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
SENP3Q9H4L4 LINC01108-202ENST00000635227 776 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SENP3Q9H4L4 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SENP3Q9H4L4 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SENP3Q9H4L4 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SENP3Q9H4L4 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SENP3Q9H4L4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SENP3Q9H4L4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SENP3Q9H4L4 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SENP3Q9H4L4 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SENP3Q9H4L4 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SENP3Q9H4L4 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SENP3Q9H4L4 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SENP3Q9H4L4 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SENP3Q9H4L4 PSG5-207ENST00000407568 1064 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SENP3Q9H4L4 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
SENP3Q9H4L4 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
SENP3Q9H4L4 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SENP3Q9H4L4 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SENP3Q9H4L4 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SENP3Q9H4L4 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SENP3Q9H4L4 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
SENP3Q9H4L4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SENP3Q9H4L4 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SENP3Q9H4L4 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SENP3Q9H4L4 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SENP3Q9H4L4 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SENP3Q9H4L4 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SENP3Q9H4L4 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SENP3Q9H4L4 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SENP3Q9H4L4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SENP3Q9H4L4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SENP3Q9H4L4 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SENP3Q9H4L4 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
SENP3Q9H4L4 KRTAP4-6-201ENST00000345847 1055 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SENP3Q9H4L4 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SENP3Q9H4L4 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SENP3Q9H4L4 AL161640.1-201ENST00000429507 390 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SENP3Q9H4L4 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
SENP3Q9H4L4 RFC3P1-201ENST00000454568 682 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
SENP3Q9H4L4 LINC00973-201ENST00000473756 962 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SENP3Q9H4L4 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SENP3Q9H4L4 C15orf40-209ENST00000538348 561 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SENP3Q9H4L4 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SENP3Q9H4L4 MTND4LP25-201ENST00000570218 163 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
SENP3Q9H4L4 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.3 ms