Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2S6

TNMD, Tenomodulin, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNMDQ9H2S6 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNMDQ9H2S6 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNMDQ9H2S6 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNMDQ9H2S6 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNMDQ9H2S6 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNMDQ9H2S6 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNMDQ9H2S6 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNMDQ9H2S6 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNMDQ9H2S6 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNMDQ9H2S6 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNMDQ9H2S6 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNMDQ9H2S6 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNMDQ9H2S6 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNMDQ9H2S6 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNMDQ9H2S6 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNMDQ9H2S6 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNMDQ9H2S6 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNMDQ9H2S6 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNMDQ9H2S6 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNMDQ9H2S6 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TNMDQ9H2S6 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNMDQ9H2S6 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNMDQ9H2S6 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNMDQ9H2S6 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNMDQ9H2S6 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNMDQ9H2S6 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TNMDQ9H2S6 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNMDQ9H2S6 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNMDQ9H2S6 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNMDQ9H2S6 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNMDQ9H2S6 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNMDQ9H2S6 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNMDQ9H2S6 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNMDQ9H2S6 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNMDQ9H2S6 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNMDQ9H2S6 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNMDQ9H2S6 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TNMDQ9H2S6 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNMDQ9H2S6 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNMDQ9H2S6 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNMDQ9H2S6 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNMDQ9H2S6 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNMDQ9H2S6 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNMDQ9H2S6 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNMDQ9H2S6 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNMDQ9H2S6 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNMDQ9H2S6 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNMDQ9H2S6 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNMDQ9H2S6 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNMDQ9H2S6 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNMDQ9H2S6 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNMDQ9H2S6 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNMDQ9H2S6 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNMDQ9H2S6 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNMDQ9H2S6 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNMDQ9H2S6 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNMDQ9H2S6 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNMDQ9H2S6 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNMDQ9H2S6 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNMDQ9H2S6 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNMDQ9H2S6 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNMDQ9H2S6 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNMDQ9H2S6 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNMDQ9H2S6 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNMDQ9H2S6 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNMDQ9H2S6 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNMDQ9H2S6 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNMDQ9H2S6 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNMDQ9H2S6 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNMDQ9H2S6 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNMDQ9H2S6 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNMDQ9H2S6 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNMDQ9H2S6 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TNMDQ9H2S6 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNMDQ9H2S6 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TNMDQ9H2S6 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNMDQ9H2S6 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNMDQ9H2S6 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNMDQ9H2S6 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNMDQ9H2S6 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNMDQ9H2S6 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNMDQ9H2S6 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNMDQ9H2S6 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNMDQ9H2S6 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNMDQ9H2S6 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNMDQ9H2S6 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNMDQ9H2S6 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNMDQ9H2S6 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNMDQ9H2S6 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNMDQ9H2S6 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNMDQ9H2S6 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNMDQ9H2S6 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNMDQ9H2S6 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNMDQ9H2S6 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNMDQ9H2S6 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNMDQ9H2S6 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNMDQ9H2S6 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNMDQ9H2S6 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNMDQ9H2S6 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TNMDQ9H2S6 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms