Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZY9

TRIM31, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM31, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM31Q9BZY9 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM31Q9BZY9 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM31Q9BZY9 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM31Q9BZY9 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM31Q9BZY9 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM31Q9BZY9 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM31Q9BZY9 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM31Q9BZY9 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM31Q9BZY9 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM31Q9BZY9 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM31Q9BZY9 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM31Q9BZY9 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM31Q9BZY9 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM31Q9BZY9 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM31Q9BZY9 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM31Q9BZY9 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM31Q9BZY9 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM31Q9BZY9 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM31Q9BZY9 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM31Q9BZY9 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM31Q9BZY9 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM31Q9BZY9 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM31Q9BZY9 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM31Q9BZY9 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM31Q9BZY9 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM31Q9BZY9 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM31Q9BZY9 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM31Q9BZY9 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM31Q9BZY9 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM31Q9BZY9 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM31Q9BZY9 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TRIM31Q9BZY9 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM31Q9BZY9 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM31Q9BZY9 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM31Q9BZY9 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM31Q9BZY9 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM31Q9BZY9 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM31Q9BZY9 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM31Q9BZY9 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM31Q9BZY9 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM31Q9BZY9 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM31Q9BZY9 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM31Q9BZY9 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM31Q9BZY9 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM31Q9BZY9 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM31Q9BZY9 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM31Q9BZY9 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRIM31Q9BZY9 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM31Q9BZY9 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM31Q9BZY9 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM31Q9BZY9 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM31Q9BZY9 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM31Q9BZY9 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM31Q9BZY9 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM31Q9BZY9 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM31Q9BZY9 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM31Q9BZY9 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM31Q9BZY9 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM31Q9BZY9 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM31Q9BZY9 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM31Q9BZY9 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM31Q9BZY9 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM31Q9BZY9 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM31Q9BZY9 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM31Q9BZY9 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM31Q9BZY9 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM31Q9BZY9 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM31Q9BZY9 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM31Q9BZY9 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM31Q9BZY9 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM31Q9BZY9 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM31Q9BZY9 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM31Q9BZY9 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM31Q9BZY9 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM31Q9BZY9 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM31Q9BZY9 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM31Q9BZY9 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM31Q9BZY9 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM31Q9BZY9 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM31Q9BZY9 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM31Q9BZY9 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM31Q9BZY9 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM31Q9BZY9 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM31Q9BZY9 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM31Q9BZY9 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM31Q9BZY9 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM31Q9BZY9 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM31Q9BZY9 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM31Q9BZY9 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM31Q9BZY9 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM31Q9BZY9 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM31Q9BZY9 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM31Q9BZY9 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM31Q9BZY9 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM31Q9BZY9 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM31Q9BZY9 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM31Q9BZY9 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM31Q9BZY9 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM31Q9BZY9 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM31Q9BZY9 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms